RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 IFI27L1Q96BM0 104 aa10.01□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 SDHAF1A6NFY7 115 aa10□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 H0Y8G0 127 aa10□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00173Q6ZV60 143 aa10□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 A0A096LNI7 61 aa9.99□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 A0A096LNJ9 63 aa9.99□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 UBE2L6O14933 153 aa9.99□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.98□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.98□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.97□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 GAGE12HA6NDE8 117 aa9.97□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 I3L3M4 83 aa9.97□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.97□□□□□ -0.81
SPCS1-201ENST00000233025 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 LINC01545Q5VT33 79 aa9.96□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 Q6ZN92 141 aa9.96□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 TOMM6Q96B49 74 aa9.96□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.96□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.95□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.95□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 PRO1933Q9H354 126 aa9.95□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.95□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.94□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA45Q537H7 98 aa9.94□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 H7C423 109 aa9.93□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 FGF6P10767 208 aa9.93□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 ATOH7Q8N100 152 aa9.93□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 FOXI1Q12951 378 aa9.92□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.92□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 CFAP161Q6P656 301 aa9.92□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 ERASQ7Z444 233 aa9.92□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM141Q96I45 108 aa9.92□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.91□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 TSHBP01222 138 aa9.9□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.9□□□□□ -0.82
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.89□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 DDTP30046 118 aa9.89□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 TIMM17AQ99595 171 aa9.89□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.89□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.88□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 DPM2O94777 84 aa9.88□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.88□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.88□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.87□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 IGKCP01834 107 aa9.87□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 PLNP26678 52 aa9.87□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 XCL1P47992 114 aa9.87□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.87□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.87□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 CCL25O15444 150 aa9.86□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 F8VRH5 84 aa9.85□□□□□ -0.83
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SPCS1-201ENST00000233025 PMVKQ15126 192 aa9.85□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.85□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.84□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 IGIPA6NJ69 53 aa9.84□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00587B1AMM8 73 aa9.84□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 NPSP0C0P6 89 aa9.84□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.84□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 DIRC1Q969H9 104 aa9.84□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.84□□□□□ -0.83
SPCS1-201ENST00000233025 IGLC3P0DOY3 106 aa9.83□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM101Q96IK0 257 aa9.83□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 CARD19Q96LW7 228 aa9.83□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.83□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.83□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf137Q5JT78 98 aa9.82□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.82□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 VCX2Q9H322 139 aa9.82□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.82□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 H0Y9J4 135 aa9.81□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.81□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 C14orf144Q96I85 54 aa9.81□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.8□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 CST9LQ9H4G1 147 aa9.8□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 HERVK_113P61574 105 aa9.79□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 SS18Q15532 418 aa9.79□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.79□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.78□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV7-43P04211 117 aa9.78□□□□□ -0.84
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SPCS1-201ENST00000233025 PTTG1IPP53801 180 aa9.78□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 SYCNQ0VAF6 134 aa9.78□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.78□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa9.78□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa9.78□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.78□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PNN7 141 aa9.77□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 NMUP48645 174 aa9.77□□□□□ -0.85
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.77□□□□□ -0.85
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