RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

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Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 BEAN1Q3B7T3 259 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A0J9YWU9 116 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 A8MZ25 164 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 EML5Q05BV3 1969 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 H0Y9J4 135 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 Q8N2B8 174 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRVP-205ENST00000641549 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 C7orf33Q8WU49 177 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 LINC00310P59036 64 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 LST1O00453 97 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 UPK3BQ9BT76 320 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 FHL2Q14192 279 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 SLPIP03973 132 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 NUPR2A6NF83 97 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 CYSRT1A8MQ03 144 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 J3KT08 172 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 AMELXQ99217 191 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 ABCA12Q86UK0 2595 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRVP-205ENST00000641549 F8WDY8 70 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 Q6ZQY7 126 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 IGKV2D-28P01615 120 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A1B0GUV1 79 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 CCKP06307 115 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 JMJD1CQ15652 2540 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A096LNI7 61 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 TLN2Q9Y4G6 2542 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 RETNQ9HD89 108 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 Q6ZTC4 211 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 LINC00694P0DN24 101 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 IMUPQ9GZP8 106 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 M0R2N4 97 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A096LNJ9 63 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 MT-ATP8P03928 68 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 LY6G6CO95867 125 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-205ENST00000641549 UQCRQO14949 82 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 COX6A2Q02221 97 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 ENHOQ6UWT2 76 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 IGKV4-1P06312 121 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 Q6ZSN1 163 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 C2orf48Q96LS8 159 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 FHL3Q13643 280 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 NDUFC2O95298 119 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 LRRK2Q5S007 2527 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 CHD8Q9HCK8 2581 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF462Q96JM2 2506 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 LINC01546A6NGU7 62 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 SCXQ7RTU7 201 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 KLK9Q2XQG4 91 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRVP-205ENST00000641549 USP17L23D6RBM5 183 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-205ENST00000641549 C3orf84H3BNL1 204 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-205ENST00000641549 M0QXV9 152 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-205ENST00000641549 C5orf47Q569G3 176 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-205ENST00000641549 C20orf197Q8N268 126 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRVP-205ENST00000641549 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.52□□□□□ -0.89
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