RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		10.57	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		10.57	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM141	Q96I45	108 aa		10.57	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		10.57	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		10.57	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		10.57	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		10.56	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		10.56	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		10.56	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	10.56	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		10.55	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		10.55	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	NDUFA5	Q16718	116 aa		10.55	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM104A	Q969W3	186 aa		10.55	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	VCX2	Q9H322	139 aa		10.55	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPAG11B	Q08648	103 aa		10.54	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		10.54	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	C2orf48	Q96LS8	159 aa		10.54	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAT1	Q14517	4588 aa		10.54	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		10.53	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	MT-ND6	P03923	174 aa		10.53	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		10.53	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		10.53	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q6ZRU5	148 aa		10.53	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	STPG4	Q8N801	248 aa		10.53	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	C7orf33	Q8WU49	177 aa		10.53	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		10.53	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		10.53	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A096LNI7	61 aa		10.52	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		10.52	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035		J3QL48	77 aa		10.52	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	APOC3	P02656	99 aa		10.52	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	NPS	P0C0P6	89 aa		10.52	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	GAGE2B	Q13066	116 aa		10.51	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		10.51	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		10.5	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035		F8WDY8	70 aa		10.5	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	SNAPIN	O95295	136 aa		10.5	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGIP	A6NJ69	53 aa		10.49	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBE2D1	P51668	147 aa		10.49	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	SVBP	Q8N300	66 aa		10.49	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		10.49	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A087WZ39	114 aa		10.48	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC01549	A6NIU2	74 aa		10.48	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	NDUFA1	O15239	70 aa		10.48	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	SEC11A	P67812	179 aa		10.48	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	FA2H	Q7L5A8	372 aa		10.48	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	TOMM6	Q96B49	74 aa		10.48	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		10.48	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	AMELX	Q99217	191 aa		10.48	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTTG1IP	P53801	180 aa		10.47	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNF151	Q2KHN1	245 aa		10.47	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		10.47	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	TIMM17A	Q99595	171 aa		10.47	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		10.47	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERAS	Q7Z444	233 aa		10.46	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A0J9YXV3	536 aa		10.45	□□□□□ -0.74
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRSS2	P07478	247 aa		10.45	□□□□□ -0.74
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		10.45	□□□□□ -0.74
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		10.45	□□□□□ -0.74
JMJD1C-211	ENST00000633035	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
JMJD1C-211	ENST00000633035	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
JMJD1C-211	ENST00000633035	HERVK_113	P63121	156 aa		10.44	□□□□□ -0.74
JMJD1C-211	ENST00000633035	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
JMJD1C-211	ENST00000633035	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		10.43	□□□□□ -0.74
JMJD1C-211	ENST00000633035	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		10.42	□□□□□ -0.74
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC01546	A6NGU7	62 aa		10.41	□□□□□ -0.74
JMJD1C-211	ENST00000633035	OXT	P01178	125 aa		10.41	□□□□□ -0.74
JMJD1C-211	ENST00000633035	CKS1B	P61024	79 aa		10.41	□□□□□ -0.74
JMJD1C-211	ENST00000633035	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		10.41	□□□□□ -0.74
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		10.41	□□□□□ -0.74
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIAA0087	Q14695	138 aa		10.4	□□□□□ -0.74
JMJD1C-211	ENST00000633035	C10orf25	Q5T742	122 aa		10.4	□□□□□ -0.74
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00614	P0C842	121 aa		10.39	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		10.39	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		10.39	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		10.38	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A1W2PNN7	141 aa		10.38	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		10.38	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAB5B	P61020	215 aa		10.38	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	GAGE2E	Q4V326	116 aa		10.38	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	C2orf82	Q6UX34	121 aa		10.38	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		10.38	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		10.38	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	PMVK	Q15126	192 aa		10.37	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q6ZRP5	223 aa		10.37	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		10.37	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	CST9L	Q9H4G1	147 aa		10.37	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		10.36	□□□□□ -0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	NDUFA6	P56556	154 aa		10.36	□□□□□ -0.75

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