RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617474.1

PTPRT-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRT, Length 4,521 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-210ENST00000617474 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 C6orf99Q4VX62 202 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 REG3AQ06141 175 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 UBE2D3P61077 147 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 UBE2D2P62837 147 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 ENHOQ6UWT2 76 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 UPK3BQ9BT76 320 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 CXCL5P42830 114 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 LINC00482Q8N8I6 264 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 CENPEQ02224 2701 aa11.27□□□□□ -0.6
PTPRT-210ENST00000617474 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa11.27□□□□□ -0.61
PTPRT-210ENST00000617474 ZNF702PQ9H963 129 aa11.27□□□□□ -0.61
PTPRT-210ENST00000617474 TMEM258P61165 79 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRT-210ENST00000617474 LINC00242Q5T6M2 205 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRT-210ENST00000617474 C3orf22Q8N5N4 141 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRT-210ENST00000617474 SMIM11BQ8TCY0 68 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRT-210ENST00000617474 WDFY4Q6ZS81 3184 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRT-210ENST00000617474 TIMM17BO60830 172 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRT-210ENST00000617474 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PTPRT-210ENST00000617474 COX7BP24311 80 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRT-210ENST00000617474 LINC00694P0DN24 101 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRT-210ENST00000617474 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRT-210ENST00000617474 COX6A2Q02221 97 aa11.22□□□□□ -0.61
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PTPRT-210ENST00000617474 USP24Q9UPU5 2620 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRT-210ENST00000617474 CCL18P55774 89 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 FAM110AQ9BQ89 295 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 RMI2Q96E14 147 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 PRORYQ9H606 182 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 ODF3L2Q3SX64 289 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 Q6ZSN1 163 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 SMIM1B2RUZ4 78 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 Q6ZQY7 126 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 C5orf47Q569G3 176 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 VPS13AQ96RL7 3174 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 NDUFS5O43920 106 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 A0A087WVE0 104 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 CDIP1Q9H305 208 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 SZT2Q5T011 3432 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 F8P00451 2351 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 BPY2O14599 106 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 PRR3P79522 188 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 IMUPQ9GZP8 106 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 FREM2Q5SZK8 3169 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRT-210ENST00000617474 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 PDE6GP18545 87 aa11.14□□□□□ -0.63
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PTPRT-210ENST00000617474 SNURFQ9Y675 71 aa11.14□□□□□ -0.63
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PTPRT-210ENST00000617474 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 A0A096LNI7 61 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 MPLKIPQ8TAP9 179 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 BRK1Q8WUW1 75 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 C3orf84H3BNL1 204 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 FAM236CP0DP71 79 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 MGAQ8IWI9 3026 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 CCKP06307 115 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 HIGD2AQ9BW72 106 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP10-9P60411 292 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 Q9UF83 564 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 A0A087WYN8 130 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 IGKV2D-28P01615 120 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 MP68P56378 58 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 LINC00315P59091 139 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 LYRM9A8MSI8 78 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 PLA2G2AP14555 144 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 Q6Q795 121 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 PRO0461Q9UI25 63 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 H3BQ85 93 aa11.08□□□□□ -0.63
PTPRT-210ENST00000617474 SMIM9A6NGZ8 99 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRT-210ENST00000617474 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRT-210ENST00000617474 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRT-210ENST00000617474 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRT-210ENST00000617474 RPL28P46779 137 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRT-210ENST00000617474 INAFM1C9JVW0 142 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRT-210ENST00000617474 VCANP13611 3396 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRT-210ENST00000617474 CYSRT1A8MQ03 144 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRT-210ENST00000617474 PCSK5Q92824 1860 aa11.04□□□□□ -0.64
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