RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 HCFC1P51610 2035 aa8.69□□□□□ -1.02
TNS1-220ENST00000611415 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.69□□□□□ -1.02
TNS1-220ENST00000611415 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.69□□□□□ -1.02
TNS1-220ENST00000611415 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-220ENST00000611415 LINC01006Q8NI28 216 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-220ENST00000611415 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-220ENST00000611415 Q8N814 137 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-220ENST00000611415 Q8N9L7 120 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-220ENST00000611415 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-220ENST00000611415 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TNS1-220ENST00000611415 COX6A2Q02221 97 aa8.67□□□□□ -1.02
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TNS1-220ENST00000611415 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
TNS1-220ENST00000611415 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.67□□□□□ -1.02
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TNS1-220ENST00000611415 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.66□□□□□ -1.02
TNS1-220ENST00000611415 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.66□□□□□ -1.02
TNS1-220ENST00000611415 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TNS1-220ENST00000611415 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.66□□□□□ -1.02
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TNS1-220ENST00000611415 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.66□□□□□ -1.02
TNS1-220ENST00000611415 A0A087WYN8 130 aa8.66□□□□□ -1.02
TNS1-220ENST00000611415 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.65□□□□□ -1.03
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TNS1-220ENST00000611415 C10orf25Q5T742 122 aa8.64□□□□□ -1.03
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TNS1-220ENST00000611415 ZNF843Q8N446 348 aa8.63□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 EML5Q05BV3 1969 aa8.63□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.63□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.62□□□□□ -1.03
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TNS1-220ENST00000611415 CACNA1HO95180 2353 aa8.62□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 A0A087WVE0 104 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 AMELXQ99217 191 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 M0R2N4 97 aa8.61□□□□□ -1.03
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TNS1-220ENST00000611415 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.61□□□□□ -1.03
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TNS1-220ENST00000611415 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.61□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 LRP4O75096 1905 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 PTPRSQ13332 1948 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 PRYO14603 147 aa8.6□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 DSCAMO60469 2012 aa8.59□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.59□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 C1orf137Q5JT78 98 aa8.59□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.59□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 A0A096LNJ9 63 aa8.59□□□□□ -1.03
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TNS1-220ENST00000611415 REG3GQ6UW15 175 aa8.59□□□□□ -1.03
TNS1-220ENST00000611415 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.59□□□□□ -1.03
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TNS1-220ENST00000611415 ESRGQ1W209 222 aa8.58□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 ZNF580Q9UK33 172 aa8.58□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 AVPP01185 164 aa8.58□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 FHL2Q14192 279 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 CDSNQ15517 529 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 LINC00208Q96KT6 92 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 PLCE1Q9P212 2302 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 NBASA2RRP1 2371 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 Q6ZSN1 163 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 TNCP24821 2201 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 Q8N3U1 123 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 BRI3O95415 125 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 C6orf223Q8N319 242 aa8.54□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 PMAIP1Q13794 54 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 IGLV1-51P01701 117 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 Q6ZVQ6 151 aa8.53□□□□□ -1.04
TNS1-220ENST00000611415 LINC00575Q6W349 94 aa8.52□□□□□ -1.04
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TNS1-220ENST00000611415 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 LY6G6CO95867 125 aa8.51□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.51□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.51□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.5□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.5□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 Q9BRP9 147 aa8.5□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.5□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 CREBBPQ92793 2442 aa8.5□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 LINC01546A6NGU7 62 aa8.49□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 A0A1B0GUV1 79 aa8.49□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 PSPHP1O15172 72 aa8.49□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 LINC00846Q9NV44 126 aa8.48□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 H0Y9P7 68 aa8.48□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 PLXNB1O43157 2135 aa8.48□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.48□□□□□ -1.05
TNS1-220ENST00000611415 C16orf95Q9H693 158 aa8.47□□□□□ -1.05
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