RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 PRSS2P07478 247 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 HERV-K104P63124 156 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 LITAFQ99732 161 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 GAGE7O76087 117 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 TCL1BO95988 128 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 GAGE12FP0CL80 117 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 GAGE12GP0CL81 117 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 GAGE12IP0CL82 117 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 SCGB1A1P11684 91 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 INSL3P51460 131 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 TEN1Q86WV5 123 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 NACAE9PAV3 2078 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 SFTA2Q6UW10 78 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 Q9UF83 564 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 PDZD2O15018 2839 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 H7C2G1 150 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXI1Q12951 378 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 SIGMAR1Q99720 223 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC25A20O43772 301 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00694P0DN24 101 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 MTURNQ8N3F0 131 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 Q9H8V8 135 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 C9JAW5 83 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 ITPR3Q14573 2671 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM262E9PQX1 116 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIAP1O43715 76 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 FHL2Q14192 279 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC01620Q4KN68 170 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC01600Q96MT4 127 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 VPS13CQ709C8 3753 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 ZANQ9Y493 2812 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 LYRM9A8MSI8 78 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 A8MZ25 164 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 F5H768 121 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 H3BT86 120 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 CRLF1O75462 422 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 APOC4P55056 127 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 COX6A2Q02221 97 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 F8P00451 2351 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 LY6G6DO95868 133 aa6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 GAGE6Q13070 117 aa6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 Q8N1X5 172 aa6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 COX7B2Q8TF08 81 aa6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 NPC2P61916 151 aa6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 SORL1Q92673 2214 aa6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-222ENST00000592408 ACANP16112 2415 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-222ENST00000592408 LST1O00453 97 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-222ENST00000592408 DEFB130BP0DP73 79 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-222ENST00000592408 DEFB130AP0DP74 79 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-222ENST00000592408 C2orf82Q6UX34 121 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE2WQ96B02 151 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-222ENST00000592408 PRO0255Q9UI72 69 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-222ENST00000592408 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-222ENST00000592408 ZFHX3Q15911 3703 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-222ENST00000592408 CRPP02741 224 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP10-3P60369 221 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-222ENST00000592408 SS18Q15532 418 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms