RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589057.5

APOC4-APOC2-202, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene APOC4-APOC2, Length 680 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.76□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.76□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NAT8Q9UHE5 227 aa6.76□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C10orf25Q5T742 122 aa6.75□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.75□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.75□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RNF213Q63HN8 5207 aa6.74□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 A0A1B0GW15 77 aa6.74□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAM168BA1KXE4 195 aa6.74□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 D6R8Y8 96 aa6.74□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 F8WDY8 70 aa6.74□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TCAPO15273 167 aa6.74□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NPYP01303 97 aa6.74□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IGLV7-43P04211 117 aa6.74□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 A0A1B0GXF2 115 aa6.73□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IFITM10A6NMD0 228 aa6.73□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NDUFA1O15239 70 aa6.73□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.73□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.73□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.73□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IMMP2LQ96T52 175 aa6.73□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.73□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HBBP68871 147 aa6.72□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KIAA0087Q14695 138 aa6.72□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.72□□□□□ -1.33
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 A0A087WZ39 114 aa6.71□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 F8W036 122 aa6.71□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 S100A8P05109 93 aa6.71□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DIRC1Q969H9 104 aa6.71□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.71□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 H0Y9J4 135 aa6.7□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PPBPP02775 128 aa6.7□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PEA15Q15121 130 aa6.7□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GAGE2EQ4V326 116 aa6.7□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.7□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.7□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.7□□□□□ -1.34
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.69□□□□□ -1.34
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ORMDL3Q8N138 153 aa6.69□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 A0A1B0GVG6 124 aa6.68□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.68□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RAB5AP20339 215 aa6.68□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C2orf82Q6UX34 121 aa6.68□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.68□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PRELID3AQ96N28 172 aa6.68□□□□□ -1.34
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 M0QXV9 152 aa6.67□□□□□ -1.34
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.67□□□□□ -1.34
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TMEM141Q96I45 108 aa6.67□□□□□ -1.34
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.66□□□□□ -1.34
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.65□□□□□ -1.34
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 Q8N8P6 123 aa6.63□□□□□ -1.35
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.63□□□□□ -1.35
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.63□□□□□ -1.35
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.62□□□□□ -1.35
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.62□□□□□ -1.35
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 Q8IZM0 81 aa6.61□□□□□ -1.35
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.61□□□□□ -1.35
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 VCX2Q9H322 139 aa6.61□□□□□ -1.35
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PRSS2P07478 247 aa6.6□□□□□ -1.35
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CKS1BP61024 79 aa6.6□□□□□ -1.35
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.6□□□□□ -1.35
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.6□□□□□ -1.35
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.6□□□□□ -1.35
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C22orf24Q9Y442 160 aa6.6□□□□□ -1.35
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 K7EMI3 77 aa6.59□□□□□ -1.35
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.59□□□□□ -1.35
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.59□□□□□ -1.35
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MT-ND4LP03901 98 aa6.58□□□□□ -1.36
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PRR4Q16378 134 aa6.58□□□□□ -1.36
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