RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 IFITM10A6NMD0 228 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 K7EMI3 77 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 COX7A2LO14548 114 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 G0S2P27469 103 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 FA2HQ7L5A8 372 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 CBLN2Q8IUK8 224 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM141Q96I45 108 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 VCX2Q9H322 139 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 SMCO4Q9NRQ5 59 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 PKHD1P08F94 4074 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 IGIPA6NJ69 53 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 COX6A2Q02221 97 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 Q8N1X5 172 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 TOMM6Q96B49 74 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 YPEL4Q96NS1 127 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 APOMO95445 188 aa4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00614P0C842 121 aa4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 Q6ZN92 141 aa4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 ERASQ7Z444 233 aa4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.37□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC01546A6NGU7 62 aa4.37□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 UBE2D1P51668 147 aa4.37□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 SYCNQ0VAF6 134 aa4.37□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.37□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 Q6ZSA8 131 aa4.37□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.37□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.37□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 AMELXQ99217 191 aa4.37□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.37□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 EPM2AB3EWF7 344 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 PANO1I0J062 215 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 TRGC2P03986 189 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 NPSP0C0P6 89 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 CHTF8P0CG12 524 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 NDUFA6P56556 154 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB5BP61020 215 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 PMCHL1Q16048 86 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 SCXQ7RTU7 201 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 ORAOV1Q8WV07 137 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 TIMM17AQ99595 171 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A087WZ39 114 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0J9YXV3 536 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC01549A6NIU2 74 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 COLCA2A8K830 154 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 SPAG11BQ08648 103 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 Q5VSD8 79 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 Q6ZRU5 148 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 CARD19Q96LW7 228 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 CST9LQ9H4G1 147 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 PMVKQ15126 192 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 MAJINQ3KP22 176 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 BAGE3Q86Y29 109 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 OR10D4PQ8NGN7 298 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 C2orf48Q96LS8 159 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A087WYN8 130 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A096LNI7 61 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A096LNJ9 63 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 HBDP02042 147 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 HERVK_113P63121 156 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 SEC11AP67812 179 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 GAGE2BQ13066 116 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA0087Q14695 138 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 C10orf25Q5T742 122 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 NDUFA1O15239 70 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 PRSS2P07478 247 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms