RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139		K7EIL1	84 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	OXT	P01178	125 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	S100A12	P80511	92 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	COTL1	Q14019	142 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A096LNJ9	63 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139		H3BNG1	76 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	CRYBA4	P53673	196 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTDAP	P60985	99 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	UBE2D3	P61077	147 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	UBE2D2	P62837	147 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	PFN2	P35080	140 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	PKIA	P61925	76 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139		Q6ZTC4	211 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	C12orf57	Q99622	126 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139		P0DMU3	169 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	PLN	P26678	52 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	REG3A	Q06141	175 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	TAL2	Q16559	108 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139		F5H768	121 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	UBE2L6	O14933	153 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	DEFB4A	O15263	64 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A087WX48	190 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139		F8VRH5	84 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	TSTD3	H0UI37	97 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	DPM2	O94777	84 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	SEC11A	P67812	179 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	PMVK	Q15126	192 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139		Q8N976	141 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	IGKC	P01834	107 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	HERVK_113	P61574	105 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	CEND1	Q8N111	149 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CNOT1-222	ENST00000570139	FGF6	P10767	208 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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