RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561668.5

PKD1-223, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 3

Gene PKD1, Length 665 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-223	ENST00000561668	AMELX	Q99217	191 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKD1-223	ENST00000561668	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
PKD1-223	ENST00000561668	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PKD1-223	ENST00000561668	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PKD1-223	ENST00000561668	TMEM141	Q96I45	108 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PKD1-223	ENST00000561668	TIMM17A	Q99595	171 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PKD1-223	ENST00000561668	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKD1-223	ENST00000561668	SLPI	P03973	132 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKD1-223	ENST00000561668	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKD1-223	ENST00000561668	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKD1-223	ENST00000561668	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKD1-223	ENST00000561668	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	MAL	P21145	153 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	ERAS	Q7Z444	233 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	COLCA2	A8K830	154 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00614	P0C842	121 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	FA2H	Q7L5A8	372 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	IFITM10	A6NMD0	228 aa		12	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		12	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	UBE2D1	P51668	147 aa		12	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		12	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668		A0A096LNJ9	63 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	COX7A2L	O14548	114 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	RAB5B	P61020	215 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668		Q6ZN92	141 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	VCX2	Q9H322	139 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	FAT1	Q14517	4588 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	APOM	O95445	188 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	COX6A2	Q02221	97 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	C5orf38	Q86SI9	138 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-223	ENST00000561668		A0A087WZ39	114 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	TRGC2	P03986	189 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	PANO1	I0J062	215 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	SYCN	Q0VAF6	134 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	C2orf48	Q96LS8	159 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	CARD19	Q96LW7	228 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668		F8WDY8	70 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	HBD	P02042	147 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	CHTF8	P0CG12	524 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	SEC11A	P67812	179 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	MAJIN	Q3KP22	176 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	CST9L	Q9H4G1	147 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668		A0A087WYN8	130 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-223	ENST00000561668	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	SCO1	O75880	301 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	HERVK_113	P63121	156 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	KIAA0087	Q14695	138 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	PMVK	Q15126	192 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	RNF151	Q2KHN1	245 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668		A0A0J9YXV3	536 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668		J3QL48	77 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	ATP5L	O75964	103 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00310	P59036	64 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	SPAG11B	Q08648	103 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	PMCHL1	Q16048	86 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	STPG4	Q8N801	248 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	C7orf33	Q8WU49	177 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668		Q6ZRU5	148 aa		11.85	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		11.85	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668		A0A096LNI7	61 aa		11.84	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		11.84	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	BAGE3	Q86Y29	109 aa		11.84	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
PKD1-223	ENST00000561668	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
PKD1-223	ENST00000561668	IGLC3	P0DOY3	106 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PKD1-223	ENST00000561668	S100A1	P23297	94 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PKD1-223	ENST00000561668	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
PKD1-223	ENST00000561668	GAGE2B	Q13066	116 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PKD1-223	ENST00000561668	HSBP1	O75506	76 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PKD1-223	ENST00000561668	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
PKD1-223	ENST00000561668	SERF1A	O75920	110 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PKD1-223	ENST00000561668		Q8IZM0	81 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PKD1-223	ENST00000561668	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PKD1-223	ENST00000561668	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PKD1-223	ENST00000561668	NDUFA1	O15239	70 aa		11.79	□□□□□ -0.52

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