RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CS-222ENST00000550996 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-222ENST00000550996 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-222ENST00000550996 IFITM10A6NMD0 228 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-222ENST00000550996 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-222ENST00000550996 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
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CS-222ENST00000550996 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
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CS-222ENST00000550996 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
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CS-222ENST00000550996 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa13.17□□□□□ -0.3
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CS-222ENST00000550996 TMEM141Q96I45 108 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-222ENST00000550996 CYSLTR1Q9Y271 337 aa13.16□□□□□ -0.3
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CS-222ENST00000550996 VCX2Q9H322 139 aa13.07□□□□□ -0.32
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CS-222ENST00000550996 TIMM17AQ99595 171 aa13.05□□□□□ -0.32
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CS-222ENST00000550996 A0A1W2PNN7 141 aa13.04□□□□□ -0.32
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CS-222ENST00000550996 OXTP01178 125 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-222ENST00000550996 C2orf82Q6UX34 121 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-222ENST00000550996 ERASQ7Z444 233 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-222ENST00000550996 LINC01561Q8N1V8 128 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-222ENST00000550996 SCGB3A1Q96QR1 104 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-222ENST00000550996 G0S2P27469 103 aa13□□□□□ -0.33
CS-222ENST00000550996 TNXBP22105 4242 aa13□□□□□ -0.33
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CS-222ENST00000550996 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-222ENST00000550996 Q6ZRP5 223 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-222ENST00000550996 FA2HQ7L5A8 372 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-222ENST00000550996 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa12.98□□□□□ -0.33
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CS-222ENST00000550996 YPEL4Q96NS1 127 aa12.97□□□□□ -0.33
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CS-222ENST00000550996 HERVK_113P63121 156 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 C18orf32Q8TCD1 76 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 FAM168BA1KXE4 195 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 CST9LQ9H4G1 147 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa12.93□□□□□ -0.34
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