RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516259.1

RNU6-390P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 390, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-390P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-390P-201ENST00000516259 UBE2D2P62837 147 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-390P-201ENST00000516259 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-390P-201ENST00000516259 GNG8Q9UK08 70 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARHGAP5Q13017 1502 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-390P-201ENST00000516259 PTPN13Q12923 2485 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-390P-201ENST00000516259 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-390P-201ENST00000516259 USF3Q68DE3 2245 aa0.01□□□□□ -2.41
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RNU6-390P-201ENST00000516259 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-390P-201ENST00000516259 NAP1L6A6NFF2 107 aa0□□□□□ -2.41
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RNU6-390P-201ENST00000516259 NSD3Q9BZ95 1437 aa0□□□□□ -2.41
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RNU6-390P-201ENST00000516259 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
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RNU6-390P-201ENST00000516259 PRO1854Q9UHT4 67 aa-0.03□□□□□ -2.41
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RNU6-390P-201ENST00000516259 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-0.03□□□□□ -2.41
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RNU6-390P-201ENST00000516259 KIAA0556O60303 1618 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-390P-201ENST00000516259 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-390P-201ENST00000516259 HSD52Q0P140 79 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-390P-201ENST00000516259 LINC00846Q9NV44 126 aa-0.05□□□□□ -2.42
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RNU6-390P-201ENST00000516259 C10orf113Q5VZT2 155 aa-0.06□□□□□ -2.42
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RNU6-390P-201ENST00000516259 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-390P-201ENST00000516259 C12orf57Q99622 126 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-390P-201ENST00000516259 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
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RNU6-390P-201ENST00000516259 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
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RNU6-390P-201ENST00000516259 COL4A6Q14031 1691 aa-0.1□□□□□ -2.43
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RNU6-390P-201ENST00000516259 SFTA2Q6UW10 78 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-390P-201ENST00000516259 FDCSPQ8NFU4 85 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-390P-201ENST00000516259 LINC01600Q96MT4 127 aa-0.1□□□□□ -2.43
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