RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513095.5

SH3BP2-226, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 609 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-226ENST00000513095 Q6ZN92 141 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 AMELXQ99217 191 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 TIMM17AQ99595 171 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 VCX2Q9H322 139 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 ABCA13Q86UQ4 5058 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 UBE2D1P51668 147 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 ERASQ7Z444 233 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 LINC01549A6NIU2 74 aa9.09□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.09□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 APOMO95445 188 aa9.09□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 LINC00614P0C842 121 aa9.09□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 COX6A2Q02221 97 aa9.09□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.09□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 SCXQ7RTU7 201 aa9.09□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.09□□□□□ -0.95
SH3BP2-226ENST00000513095 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 A0A087WZ39 114 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 A0A096LNJ9 63 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 PANO1I0J062 215 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 PCLOQ9Y6V0 5065 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 COLCA2A8K830 154 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 RAB5BP61020 215 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 SPAG11BQ08648 103 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 SYCNQ0VAF6 134 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 CARD19Q96LW7 228 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 EPM2AB3EWF7 344 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 TRGC2P03986 189 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 PMCHL1Q16048 86 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 C2orf48Q96LS8 159 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 HBDP02042 147 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 CHTF8P0CG12 524 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 Q5VSD8 79 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 Q6ZRU5 148 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 A0A0J9YXV3 536 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 SCO1O75880 301 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 SEC11AP67812 179 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 CST9LQ9H4G1 147 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-226ENST00000513095 FAM229AH3BQW9 127 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 HERVK_113P63121 156 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 PMVKQ15126 192 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 A0A096LNI7 61 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 KIAA0087Q14695 138 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 F8WDY8 70 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 BAGE3Q86Y29 109 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 DPH3Q96FX2 82 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 PKIGQ9Y2B9 76 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 A0A087WYN8 130 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 NDUFA1O15239 70 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 C10orf25Q5T742 122 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 ATP5LO75964 103 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 NDUFA6P56556 154 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 RNF151Q2KHN1 245 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 MAJINQ3KP22 176 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 HSBP1O75506 76 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP2-226ENST00000513095 PTTG1IPP53801 180 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-226ENST00000513095 LINC00310P59036 64 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-226ENST00000513095 C2orf82Q6UX34 121 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-226ENST00000513095 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-226ENST00000513095 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-226ENST00000513095 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-226ENST00000513095 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-226ENST00000513095 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-226ENST00000513095 SERF1AO75920 110 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-226ENST00000513095 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-226ENST00000513095 PRSS2P07478 247 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.6 ms