RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495428.5

CMC1-211, Transcript of C-X9-C motif containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene CMC1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1-211ENST00000495428 TEX29Q8N6K0 151 aa-0.55□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 MNS1Q8NEH6 495 aa-0.55□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 OR4S1Q8NGB4 309 aa-0.55□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 BIN3Q9NQY0 253 aa-0.55□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-0.55□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 ARHGAP5Q13017 1502 aa-0.55□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 AKAP12Q02952 1782 aa-0.55□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 NSD3Q9BZ95 1437 aa-0.55□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 TMEM189A5PLL7 270 aa-0.56□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 EDF1O60869 148 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 SLC25A4P12235 298 aa-0.56□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 SDC2P34741 201 aa-0.56□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 FAM24BQ8N5W8 94 aa-0.56□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 OR8J3Q8NGG0 315 aa-0.56□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 DYDC1Q8WWB3 177 aa-0.56□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 DMAC1Q96GE9 116 aa-0.56□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 PRR15LQ9BU68 103 aa-0.56□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 MYH3P11055 1940 aa-0.56□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 ATP7AQ04656 1500 aa-0.57□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 MYH13Q9UKX3 1938 aa-0.57□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 A0A0G2JMM0 328 aa-0.57□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa-0.57□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa-0.57□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 C20orf202A1L168 122 aa-0.57□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 CLPSL1A2RUU4 121 aa-0.57□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 K7EQZ3 153 aa-0.57□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 TNFP01375 233 aa-0.57□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 S100A11P31949 105 aa-0.57□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 RHOHQ15669 191 aa-0.57□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 TMED4Q7Z7H5 227 aa-0.57□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 STX19Q8N4C7 294 aa-0.57□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 AP3S1Q92572 193 aa-0.57□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-0.57□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa-0.58□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa-0.58□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-0.58□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 YPEL1O60688 119 aa-0.58□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 E2F6O75461 281 aa-0.58□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 TNFSF15O95150 251 aa-0.58□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 BLCAPP62952 87 aa-0.58□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 BASP1P80723 227 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 LINC00305Q7Z4B0 112 aa-0.58□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 MORN4Q8NDC4 146 aa-0.58□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 OR5A2Q8NGI9 324 aa-0.58□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 NAT14Q8WUY8 206 aa-0.58□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa-0.58□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 NINQ8N4C6 2090 aa-0.58□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa-0.59□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 SYCP2Q9BX26 1530 aa-0.59□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 CD163L1Q9NR16 1453 aa-0.59□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa-0.59□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 IFITM5A6NNB3 132 aa-0.59□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 CCKP06307 115 aa-0.59□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 TCTAP57738 103 aa-0.59□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 DEFB1P60022 68 aa-0.59□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 HRCT1Q6UXD1 115 aa-0.59□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 OR51A4Q8NGJ6 313 aa-0.59□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 DSCR8Q96T75 97 aa-0.59□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 ATG5Q9H1Y0 275 aa-0.59□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 KIF20BQ96Q89 1820 aa-0.59□□□□□ -2.5
CMC1-211ENST00000495428 IFNA21P01568 189 aa-0.6□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 IFNA17P01571 189 aa-0.6□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 IFITM1P13164 125 aa-0.6□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 CRYBA4P53673 196 aa-0.6□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 DCUN1D2Q6PH85 259 aa-0.6□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 STOML2Q9UJZ1 356 aa-0.6□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 SPEF2Q9C093 1822 aa-0.61□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 MYH1P12882 1939 aa-0.61□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 A0A087WTM6 91 aa-0.61□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa-0.61□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 H3BMG7 143 aa-0.61□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 CRYGSP22914 178 aa-0.61□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 SERPINB1P30740 379 aa-0.61□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 SDC4P31431 198 aa-0.61□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 SMIM7Q9BQ49 75 aa-0.61□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa-0.62□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa-0.62□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 SRP9P49458 86 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 UBE2D1P51668 147 aa-0.62□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 TFF3Q07654 80 aa-0.62□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 BPESC1Q9GZL8 116 aa-0.62□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 COA4Q9NYJ1 87 aa-0.62□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa-0.62□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 IQGAP2Q13576 1575 aa-0.62□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 UACAQ9BZF9 1416 aa-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 C9JAW5 83 aa-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 TMEM238C9JI98 176 aa-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 F2Z2F3 143 aa-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 M0QZK8 103 aa-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 PIRTP0C851 137 aa-0.63□□□□□ -2.51
CMC1-211ENST00000495428 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.8 ms