RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 DCANP1Q8TF63 244 aa9.07□□□□□ -0.96
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00694P0DN24 101 aa9.07□□□□□ -0.96
TRIOBP-211ENST00000492485 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.07□□□□□ -0.96
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.07□□□□□ -0.96
TRIOBP-211ENST00000492485 SS18Q15532 418 aa9.06□□□□□ -0.96
TRIOBP-211ENST00000492485 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
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TRIOBP-211ENST00000492485 COX6A2Q02221 97 aa9.06□□□□□ -0.96
TRIOBP-211ENST00000492485 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.06□□□□□ -0.96
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TRIOBP-211ENST00000492485 KLLNB2CW77 178 aa9.04□□□□□ -0.96
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TRIOBP-211ENST00000492485 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
TRIOBP-211ENST00000492485 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.03□□□□□ -0.96
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TRIOBP-211ENST00000492485 A0A0B4J2C4 111 aa9.02□□□□□ -0.96
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TRIOBP-211ENST00000492485 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa9.02□□□□□ -0.97
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TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.02□□□□□ -0.97
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TRIOBP-211ENST00000492485 H3BT86 120 aa9.01□□□□□ -0.97
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TRIOBP-211ENST00000492485 C20orf197Q8N268 126 aa9.01□□□□□ -0.97
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TRIOBP-211ENST00000492485 A8MTW9 85 aa9□□□□□ -0.97
TRIOBP-211ENST00000492485 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
TRIOBP-211ENST00000492485 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9□□□□□ -0.97
TRIOBP-211ENST00000492485 K7EMT4 169 aa9□□□□□ -0.97
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP10-9P60411 292 aa9□□□□□ -0.97
TRIOBP-211ENST00000492485 IGSF10Q6WRI0 2623 aa9□□□□□ -0.97
TRIOBP-211ENST00000492485 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
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TRIOBP-211ENST00000492485 KLK12Q9UKR0 248 aa8.99□□□□□ -0.97
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TRIOBP-211ENST00000492485 COX7A2LO14548 114 aa8.99□□□□□ -0.97
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TRIOBP-211ENST00000492485 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.99□□□□□ -0.97
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TRIOBP-211ENST00000492485 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.97□□□□□ -0.97
TRIOBP-211ENST00000492485 RNF152Q8N8N0 203 aa8.97□□□□□ -0.97
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TRIOBP-211ENST00000492485 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.96□□□□□ -0.98
TRIOBP-211ENST00000492485 DSCR8Q96T75 97 aa8.96□□□□□ -0.98
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TRIOBP-211ENST00000492485 CCL18P55774 89 aa8.9□□□□□ -0.98
TRIOBP-211ENST00000492485 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
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TRIOBP-211ENST00000492485 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.9□□□□□ -0.98
TRIOBP-211ENST00000492485 M0QXV9 152 aa8.9□□□□□ -0.98
TRIOBP-211ENST00000492485 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 SMR3AQ99954 134 aa8.9□□□□□ -0.99
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