RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 COX6A2Q02221 97 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 C2orf48Q96LS8 159 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 NOTCH2Q04721 2471 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 K7EQD1 137 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 GAGE12JA6NER3 117 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 GAGE7O76087 117 aa6.23□□□□□ -1.41
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PKP4-210ENST00000480171 GAGE12GP0CL81 117 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 GAGE12IP0CL82 117 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 GAGE4Q13068 117 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 CRLF1O75462 422 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 TENM4Q6N022 2769 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 COX7A2LO14548 114 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 UBE2L6O14933 153 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 LINC00694P0DN24 101 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
PKP4-210ENST00000480171 GHRHP01286 108 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.21□□□□□ -1.42
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PKP4-210ENST00000480171 ACYP1P07311 99 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
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PKP4-210ENST00000480171 Q6ZTI0 123 aa6.2□□□□□ -1.42
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PKP4-210ENST00000480171 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.2□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 J3KT08 172 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 J3QL48 77 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 TRACP01848 142 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 CD164Q04900 197 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 TMEM126AQ9H061 195 aa6.19□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.19□□□□□ -1.42
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PKP4-210ENST00000480171 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.18□□□□□ -1.42
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PKP4-210ENST00000480171 COX7B2Q8TF08 81 aa6.17□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 CRPP02741 224 aa6.17□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 HILS1P60008 231 aa6.17□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.17□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 X6R8D5 127 aa6.17□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.16□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.16□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.16□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 ACANP16112 2415 aa6.16□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.16□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 KRTAP10-9P60411 292 aa6.16□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 IMUPQ9GZP8 106 aa6.16□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 ITPR2Q14571 2701 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-210ENST00000480171 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.15□□□□□ -1.43
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PKP4-210ENST00000480171 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-210ENST00000480171 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-210ENST00000480171 LINC00158P58513 81 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-210ENST00000480171 DNAL4O96015 105 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-210ENST00000480171 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-210ENST00000480171 A0A0U1RQV1 116 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-210ENST00000480171 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-210ENST00000480171 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-210ENST00000480171 APCP25054 2843 aa6.13□□□□□ -1.43
PKP4-210ENST00000480171 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-210ENST00000480171 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-210ENST00000480171 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PKP4-210ENST00000480171 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PKP4-210ENST00000480171 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-210ENST00000480171 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.12□□□□□ -1.43
PKP4-210ENST00000480171 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.12□□□□□ -1.43
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