RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		0.96	□□□□□ -2.25
RBM39-231	ENST00000477334	RYR1	P21817	5038 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	PRDM2	Q13029	1718 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334		F8VRH5	84 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	GNGT2	O14610	69 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334		Q6ZRX8	168 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	GOLGA3	Q08378	1498 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	STAB1	Q9NY15	2570 aa		0.96	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	DOCK1	Q14185	1865 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	CREBBP	Q92793	2442 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	DOCK2	Q92608	1830 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	UQCR11	O14957	56 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	SEC11A	P67812	179 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	BAGE2	Q86Y30	109 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	DPY30	Q9C005	99 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	ALK	Q9UM73	1620 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF609	O15014	1411 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		0.95	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	LRP6	O75581	1613 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	COL12A1	Q99715	3063 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	MYH8	P13535	1937 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	hADV29S1	A0JD25	119 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334		Q5VV11	94 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	AMELX	Q99217	191 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	KNTC1	P50748	2209 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	ABCC5	O15440	1437 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	IFT172	Q9UG01	1749 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	TET3	O43151	1660 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	ABCA1	O95477	2261 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	NCOR1	O75376	2440 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	UNC13B	O14795	1591 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	NDUFC1	O43677	76 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	SFT2D2	O95562	160 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	MPC2	O95563	127 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	VAMP8	Q9BV40	100 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	PDZD2	O15018	2839 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	TENM4	Q6N022	2769 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	FRYL	O94915	3013 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	DIP2A	Q14689	1571 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	MUC2	Q02817	5179 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	MYOM1	P52179	1685 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	RYR3	Q15413	4870 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334		A0A0D9SG42	100 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	ATOX1	O00244	68 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	PIN1P1	O15428	100 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	UBE2D3	P61077	147 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	UBE2D2	P62837	147 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	SFTA2	Q6UW10	78 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334		Q9H521	79 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	PROK2	Q9HC23	129 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	ABCA3	Q99758	1704 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RBM39-231	ENST00000477334	SPTA1	P02549	2419 aa		0.91	□□□□□ -2.26

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