RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZN92	141 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM141	Q96I45	108 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880		A0A096LNI7	61 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS47	A8MTI9	375 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880		J3QL48	77 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	GAGE2B	Q13066	116 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	RHEB	Q15382	184 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZRU5	148 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	STPG4	Q8N801	248 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	APOC3	P02656	99 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFA5	Q16718	116 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	FAM104A	Q969W3	186 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	C7orf33	Q8WU49	177 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	VCX2	Q9H322	139 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
SSR4-208	ENST00000471880	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880		K7EMI3	77 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0J9YXV3	536 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	G0S2	P27469	103 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	COX19	Q49B96	90 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	C2orf48	Q96LS8	159 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	MT-ND6	P03923	174 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	FA2H	Q7L5A8	372 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFA1	O15239	70 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	SNAPIN	O95295	136 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2D1	P51668	147 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	PTTG1IP	P53801	180 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	SVBP	Q8N300	66 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880		A0A087WZ39	114 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	TOMM6	Q96B49	74 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SSR4-208	ENST00000471880	IGIP	A6NJ69	53 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS2	P07478	247 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	AMELX	Q99217	191 aa		9.33	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	9.32	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	C10orf25	Q5T742	122 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	TIMM17A	Q99595	171 aa		9.32	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	NPS	P0C0P6	89 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	ERAS	Q7Z444	233 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	9.31	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880		F8WDY8	70 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	HERVK_113	P63121	156 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	SEC11A	P67812	179 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	RNF151	Q2KHN1	245 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	GAGE2E	Q4V326	116 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	C2orf82	Q6UX34	121 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	9.29	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFA6	P56556	154 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	CKS1B	P61024	79 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	9.29	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PNN7	141 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SSR4-208	ENST00000471880	LINC01549	A6NIU2	74 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SSR4-208	ENST00000471880	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
SSR4-208	ENST00000471880	OXT	P01178	125 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SSR4-208	ENST00000471880	KIAA0087	Q14695	138 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SSR4-208	ENST00000471880	PMCHL1	Q16048	86 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SSR4-208	ENST00000471880	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SSR4-208	ENST00000471880	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SSR4-208	ENST00000471880	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		9.26	□□□□□ -0.93

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