RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM104AQ969W3 186 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 DPH3Q96FX2 82 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 CARD19Q96LW7 228 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 NPSP0C0P6 89 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 COX6A2Q02221 97 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 SYCNQ0VAF6 134 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 PANO1I0J062 215 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 CHTF8P0CG12 524 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 VCX2Q9H322 139 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC01549A6NIU2 74 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 SPAG11BQ08648 103 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 C2orf48Q96LS8 159 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 IGIPA6NJ69 53 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 FA2HQ7L5A8 372 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 TOMM6Q96B49 74 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 AMELXQ99217 191 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 TIMM17AQ99595 171 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 SMCO4Q9NRQ5 59 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A087WYN8 130 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 UBE2D1P51668 147 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 MAJINQ3KP22 176 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A087WZ39 114 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A096LNI7 61 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC01546A6NGU7 62 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 F8WDY8 70 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 Q6ZRU5 148 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 ERASQ7Z444 233 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 SEC11AP67812 179 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 NDUFA1O15239 70 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF151Q2KHN1 245 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 STPG4Q8N801 248 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 PTTG1IPP53801 180 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 HERVK_113P63121 156 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 C18orf32Q8TCD1 76 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 C7orf33Q8WU49 177 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
SH3BP1-205ENST00000466097 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 GAGE2BQ13066 116 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 RAB5BP61020 215 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 PRSS2P07478 247 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00614P0C842 121 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 YPEL4Q96NS1 127 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A0J9YXV3 536 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 KIAA0087Q14695 138 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 HBDP02042 147 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 PMVKQ15126 192 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 C10orf25Q5T742 122 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 CBLN2Q8IUK8 224 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 CST9LQ9H4G1 147 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 CKS1BP61024 79 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP1-205ENST00000466097 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP1-205ENST00000466097 Q8IZM0 81 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP1-205ENST00000466097 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A096LNJ9 63 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP1-205ENST00000466097 C2orf82Q6UX34 121 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms