RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 C20orf78Q9BR46 151 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 SEC11CQ9BY50 192 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 MYCBP2O75592 4640 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 CHTF8P0CG12 524 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 VPREB1P12018 145 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 FCER1GP30273 86 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 XCL1P47992 114 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 ORMDL3Q8N138 153 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 PRELID3AQ96N28 172 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 KIR2DL4Q99706 377 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 PHOX2AO14813 284 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R17O96001 155 aa4.47□□□□□ -1.69
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RABGEF1-206ENST00000461017 S100A8P05109 93 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM101Q96IK0 257 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 BTF3L4Q96K17 158 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 IMMP2LQ96T52 175 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.47□□□□□ -1.69
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 COX6A2Q02221 97 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 C5orf38Q86SI9 138 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6V1G1O75348 118 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 PTTG1IPP53801 180 aa4.45□□□□□ -1.7
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RABGEF1-206ENST00000461017 SS18Q15532 418 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 LCE4AQ5TA78 99 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 Q8N8P6 123 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP1LC3AQ9H492 121 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS10P5Q9NQ39 176 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087WYN8 130 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A096LNI7 61 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.43□□□□□ -1.7
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RABGEF1-206ENST00000461017 B5MCH6 92 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZRU5 148 aa4.43□□□□□ -1.7
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RABGEF1-206ENST00000461017 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM18Q96B42 140 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0J9YXV3 536 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 IGIPA6NJ69 53 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB5AP20339 215 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2D1P51668 147 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 C10orf25Q5T742 122 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 YPEL4Q96NS1 127 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 AMELXQ99217 191 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 GNB1LQ9BYB4 327 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.41□□□□□ -1.7
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RABGEF1-206ENST00000461017 LINC01546A6NGU7 62 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 IFITM10A6NMD0 228 aa4.41□□□□□ -1.7
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RABGEF1-206ENST00000461017 APOC3P02656 99 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 S100A12P80511 92 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 SYCNQ0VAF6 134 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA0087Q14695 138 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 RHEBQ15382 184 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 CARD19Q96LW7 228 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.41□□□□□ -1.7
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RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PNN7 141 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 S100PP25815 95 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 TOMM6Q96B49 74 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM141Q96I45 108 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
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