RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPYP01303 97 aa16.19■□□□□ 0.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM104AQ969W3 186 aa16.19■□□□□ 0.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IMMP2LQ96T52 175 aa16.12■□□□□ 0.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRP2P98164 4655 aa16.12■□□□□ 0.17
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C10orf25Q5T742 122 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf137Q5JT78 98 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLX1NBP0CAT3 122 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C6orf48Q9UBA6 75 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa16.04■□□□□ 0.16
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00242Q5T6M2 205 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM141Q96I45 108 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa16.02■□□□□ 0.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM168BA1KXE4 195 aa16.02■□□□□ 0.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRSS47A8MTI9 375 aa16.02■□□□□ 0.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa16.02■□□□□ 0.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA0087Q14695 138 aa16.01■□□□□ 0.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP1LC3AQ9H492 121 aa16.01■□□□□ 0.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAGE2EQ4V326 116 aa16■□□□□ 0.15
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV7-43P04211 117 aa15.98■□□□□ 0.15
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MT-ND4LP03901 98 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBE2D1P51668 147 aa15.97■□□□□ 0.15
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANAPC16Q96DE5 110 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C2orf88Q9BSF0 95 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYSLTR1Q9Y271 337 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DIRC1Q969H9 104 aa15.96■□□□□ 0.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C2orf82Q6UX34 121 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C2orf66Q6UXQ4 117 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q6ZN92 141 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC01561Q8N1V8 128 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VCX2Q9H322 139 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF213Q63HN8 5207 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ORMDL2Q53FV1 153 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 M0QXV9 152 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00173Q6ZV60 143 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMELXQ99217 191 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H0Y9J4 135 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 K7EMI3 77 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRSS2P07478 247 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPSP0C0P6 89 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB14P61106 215 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBE2BP63146 152 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRR26Q8N8Z3 221 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGIPA6NJ69 53 aa15.87■□□□□ 0.13
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOMM7Q9P0U1 55 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CKS1BP61024 79 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTDSP1Q9GZU7 261 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C6orf226Q5I0X4 101 aa15.84■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa15.83■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q8IZM0 81 aa15.83■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 G0S2P27469 103 aa15.82■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HERVK_113P63121 156 aa15.81■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEC11AP67812 179 aa15.81■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa15.79■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00469Q8N7U9 141 aa15.79■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIMM17AQ99595 171 aa15.79■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
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