RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00614	P0C842	121 aa		9.47	□□□□□ -0.89
PTPA-222	ENST00000445241	SEC11A	P67812	179 aa		9.47	□□□□□ -0.89
PTPA-222	ENST00000445241	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		9.47	□□□□□ -0.89
PTPA-222	ENST00000445241	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		9.47	□□□□□ -0.89
PTPA-222	ENST00000445241	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		9.47	□□□□□ -0.89
PTPA-222	ENST00000445241		F8WDY8	70 aa		9.46	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	UBE2D1	P51668	147 aa		9.46	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		9.46	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		9.46	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		9.46	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		9.46	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	SLPI	P03973	132 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241		A0A087WZ39	114 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241		Q8N1X5	172 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	C2orf48	Q96LS8	159 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	HBD	P02042	147 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	LINC01620	Q4KN68	170 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	C5orf38	Q86SI9	138 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	HERVK_113	P63121	156 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	S100A6	P06703	90 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	SYCN	Q0VAF6	134 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	CARD19	Q96LW7	228 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241		A0A096LNJ9	63 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	TRGC2	P03986	189 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	PMVK	Q15126	192 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PTPA-222	ENST00000445241	ATP5L	O75964	103 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	COX6A2	Q02221	97 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	SPAG11B	Q08648	103 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	RNF151	Q2KHN1	245 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	CST9L	Q9H4G1	147 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	SCX	Q7RTU7	201 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	HERC2	O95714	4834 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	BAGE3	Q86Y29	109 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	RYR1	P21817	5038 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFA1	O15239	70 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0J9YXV3	536 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	C5orf52	A6NGY3	159 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	EPM2A	B3EWF7	344 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	FAM229A	H3BQW9	127 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA0087	Q14695	138 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZRU5	148 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	HSPG2	P98160	4391 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	HSBP1	O75506	76 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241		Q8IZM0	81 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPA-222	ENST00000445241	IGLC3	P0DOY3	106 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	HAMP	P81172	84 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	PMCHL1	Q16048	86 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		9.32	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	PRSS2	P07478	247 aa		9.32	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241		Q5VSD8	79 aa		9.32	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		9.32	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		9.32	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		9.31	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241		H3BRM9	83 aa		9.31	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	PANO1	I0J062	215 aa		9.31	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	9.31	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	9.31	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		9.31	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	CXCL5	P42830	114 aa		9.31	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		9.31	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241		A0A096LNI7	61 aa		9.3	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		9.3	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	SERF1A	O75920	110 aa		9.3	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	PTTG1IP	P53801	180 aa		9.3	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		9.3	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	DPH3	Q96FX2	82 aa		9.3	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241		A0A087WYN8	130 aa		9.29	□□□□□ -0.92
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFA6	P56556	154 aa		9.29	□□□□□ -0.92

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