RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 J3QKU1 62 aa11.31□□□□□ -0.6
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SHQ1-202ENST00000444040 H7C423 109 aa11.3□□□□□ -0.6
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SHQ1-202ENST00000444040 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
SHQ1-202ENST00000444040 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa11.04□□□□□ -0.64
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SHQ1-202ENST00000444040 OTOGQ6ZRI0 2925 aa11.04□□□□□ -0.64
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