RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 K7EMI3 77 aa7.76□□□□□ -1.17
PRAME-204ENST00000403441 SS18Q15532 418 aa7.76□□□□□ -1.17
PRAME-204ENST00000403441 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.76□□□□□ -1.17
PRAME-204ENST00000403441 Q8N8P6 123 aa7.76□□□□□ -1.17
PRAME-204ENST00000403441 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.76□□□□□ -1.17
PRAME-204ENST00000403441 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.76□□□□□ -1.17
PRAME-204ENST00000403441 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.76□□□□□ -1.17
PRAME-204ENST00000403441 RNF213Q63HN8 5207 aa7.76□□□□□ -1.17
PRAME-204ENST00000403441 LRP2P98164 4655 aa7.75□□□□□ -1.17
PRAME-204ENST00000403441 XCL1P47992 114 aa7.75□□□□□ -1.17
PRAME-204ENST00000403441 STPG4Q8N801 248 aa7.75□□□□□ -1.17
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PRAME-204ENST00000403441 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.74□□□□□ -1.17
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PRAME-204ENST00000403441 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.72□□□□□ -1.17
PRAME-204ENST00000403441 MT-ND6P03923 174 aa7.72□□□□□ -1.17
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PRAME-204ENST00000403441 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PRAME-204ENST00000403441 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.72□□□□□ -1.17
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PRAME-204ENST00000403441 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.7□□□□□ -1.18
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PRAME-204ENST00000403441 COX7A2LO14548 114 aa7.7□□□□□ -1.18
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PRAME-204ENST00000403441 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.65□□□□□ -1.18
PRAME-204ENST00000403441 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.65□□□□□ -1.18
PRAME-204ENST00000403441 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.64□□□□□ -1.19
PRAME-204ENST00000403441 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.64□□□□□ -1.19
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PRAME-204ENST00000403441 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.64□□□□□ -1.19
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PRAME-204ENST00000403441 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.63□□□□□ -1.19
PRAME-204ENST00000403441 Q6ZN92 141 aa7.63□□□□□ -1.19
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PRAME-204ENST00000403441 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.62□□□□□ -1.19
PRAME-204ENST00000403441 VCX2Q9H322 139 aa7.62□□□□□ -1.19
PRAME-204ENST00000403441 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
PRAME-204ENST00000403441 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.62□□□□□ -1.19
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PRAME-204ENST00000403441 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.61□□□□□ -1.19
PRAME-204ENST00000403441 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PRAME-204ENST00000403441 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.59□□□□□ -1.19
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