RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361368.6

SMURF1-202, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SMURF1-202ENST00000361368 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa14.81□□□□□ -0.04
SMURF1-202ENST00000361368 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.81□□□□□ -0.04
SMURF1-202ENST00000361368 LTBP2Q14767 1821 aa14.8□□□□□ -0.04
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SMURF1-202ENST00000361368 Q6ZS46 218 aa14.79□□□□□ -0.04
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SMURF1-202ENST00000361368 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.68□□□□□ -0.06
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SMURF1-202ENST00000361368 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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SMURF1-202ENST00000361368 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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SMURF1-202ENST00000361368 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.59□□□□□ -0.07
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SMURF1-202ENST00000361368 YPEL4Q96NS1 127 aa14.58□□□□□ -0.08
SMURF1-202ENST00000361368 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa14.56□□□□□ -0.08
SMURF1-202ENST00000361368 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa14.56□□□□□ -0.08
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SMURF1-202ENST00000361368 LIMD2Q9BT23 127 aa14.53□□□□□ -0.08
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SMURF1-202ENST00000361368 LINC00208Q96KT6 92 aa14.52□□□□□ -0.08
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SMURF1-202ENST00000361368 TRAV7A0A075B6U4 112 aa14.52□□□□□ -0.09
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SMURF1-202ENST00000361368 COX6A2Q02221 97 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF1-202ENST00000361368 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF1-202ENST00000361368 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa14.48□□□□□ -0.09
SMURF1-202ENST00000361368 LINC00694P0DN24 101 aa14.47□□□□□ -0.09
SMURF1-202ENST00000361368 AMELXQ99217 191 aa14.47□□□□□ -0.09
SMURF1-202ENST00000361368 Q8N2B8 174 aa14.46□□□□□ -0.09
SMURF1-202ENST00000361368 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
SMURF1-202ENST00000361368 X6R8D5 127 aa14.45□□□□□ -0.1
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