RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 Q6ZTC4 211 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0J9YXV3 536 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 NFE4Q86UQ8 179 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATA25Q9BR10 227 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 APOMO95445 188 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1-201ENST00000284957 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 H7C423 109 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-201ENST00000284957 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.47□□□□□ -1.37
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RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2L6O14933 153 aa6.46□□□□□ -1.37
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RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2D1P51668 147 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-201ENST00000284957 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-201ENST00000284957 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.46□□□□□ -1.38
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RABGEF1-201ENST00000284957 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.45□□□□□ -1.38
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RABGEF1-201ENST00000284957 HIST1H4GQ99525 98 aa6.45□□□□□ -1.38
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RABGEF1-201ENST00000284957 COX6A2Q02221 97 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.44□□□□□ -1.38
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RABGEF1-201ENST00000284957 IGLL5B9A064 214 aa6.43□□□□□ -1.38
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RABGEF1-201ENST00000284957 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.43□□□□□ -1.38
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RABGEF1-201ENST00000284957 Q8N3U1 123 aa6.43□□□□□ -1.38
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RABGEF1-201ENST00000284957 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.42□□□□□ -1.38
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RABGEF1-201ENST00000284957 HERVK_113P61574 105 aa6.41□□□□□ -1.38
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RABGEF1-201ENST00000284957 H7C2G1 150 aa6.4□□□□□ -1.38
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RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 HERVK_113P63121 156 aa6.39□□□□□ -1.39
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RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF815PA8K554 130 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 HIGD1BQ9P298 99 aa6.39□□□□□ -1.39
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RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.38□□□□□ -1.39
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RABGEF1-201ENST00000284957 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.38□□□□□ -1.39
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RABGEF1-201ENST00000284957 TSPAN13O95857 204 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 TTC32Q5I0X7 151 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-201ENST00000284957 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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