RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-225	ENST00000630659	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-225	ENST00000630659	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-225	ENST00000630659	SMR3A	Q99954	134 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-225	ENST00000630659	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
BBS1-225	ENST00000630659	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659		A0A0J9YXY3	114 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	DEFB136	Q30KP8	78 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	LY6G6D	O95868	133 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	SLURP1	P55000	103 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	HERVK_113	P63121	156 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	DCANP1	Q8TF63	244 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	C16orf95	Q9H693	158 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	CRYGA	P11844	174 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	HILS1	P60008	231 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	PRR9	Q5T870	116 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	COX7C	P15954	63 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	DUX3	Q96PT4	197 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	DEFB1	P60022	68 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659		F6UB75	175 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	TIMM17B	O60830	172 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	LINC00315	P59091	139 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	MIA	Q16674	131 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	PEMT	Q9UBM1	199 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659		K7EQG2	157 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	ATOX1	O00244	68 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	LINC01006	Q8NI28	216 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	LITAF	Q99732	161 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-225	ENST00000630659	CD28	P10747	220 aa		11.21	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	C5orf38	Q86SI9	138 aa		11.21	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		11.21	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		11.21	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	DAND5	Q8N907	189 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	HIVEP2	P31629	2446 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659		I3L3M4	83 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	NOTCH2	Q04721	2471 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	MTOR	P42345	2549 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM258	P61165	79 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	COPS9	Q8WXC6	57 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PRX2	142 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	PRSS2	P07478	247 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	C3orf56	Q8N813	242 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	CLEC2B	Q92478	149 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659		F5H697	171 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	CCL24	O00175	119 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	TRAC	P01848	142 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	NF1	P21359	2839 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-225	ENST00000630659	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	KLLN	B2CW77	178 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	INAFM1	C9JVW0	142 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	COX7A2L	O14548	114 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659		A0A0J9YXV3	536 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	GNRH2	O43555	120 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	C2orf48	Q96LS8	159 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	PROK1	P58294	105 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659		M0QY20	66 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	IGKV3-20	P01619	116 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	DEFB131A	P59861	70 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	SPRY2	O43597	315 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF415	Q09FC8	603 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BBS1-225	ENST00000630659	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.1 ms