RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 MIAQ16674 131 aa15.3■□□□□ 0.04
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PTPRJ-208ENST00000615445 GAS8-AS1O95177 125 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRJ-208ENST00000615445 PLA2G2AP14555 144 aa15.29■□□□□ 0.04
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PTPRJ-208ENST00000615445 TM2D2Q9BX73 214 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRJ-208ENST00000615445 Q8N976 141 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRJ-208ENST00000615445 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRJ-208ENST00000615445 EDN2P20800 178 aa15.28■□□□□ 0.04
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PTPRJ-208ENST00000615445 HIGD2BQ4VC39 106 aa15.27■□□□□ 0.03
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PTPRJ-208ENST00000615445 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa15.26■□□□□ 0.03
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PTPRJ-208ENST00000615445 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
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PTPRJ-208ENST00000615445 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa15.24■□□□□ 0.03
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PTPRJ-208ENST00000615445 PKIGQ9Y2B9 76 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRJ-208ENST00000615445 C9orf85Q96MD7 179 aa15.24■□□□□ 0.03
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PTPRJ-208ENST00000615445 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
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PTPRJ-208ENST00000615445 SPANXDQ9BXN6 97 aa15.21■□□□□ 0.03
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PTPRJ-208ENST00000615445 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa15.19■□□□□ 0.02
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PTPRJ-208ENST00000615445 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
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PTPRJ-208ENST00000615445 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa15.17■□□□□ 0.02
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PTPRJ-208ENST00000615445 UBE2D2P62837 147 aa15.04■□□□□ -0
PTPRJ-208ENST00000615445 IGIPA6NJ69 53 aa15.04■□□□□ -0
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIAP1O43715 76 aa15.04■□□□□ -0
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PTPRJ-208ENST00000615445 LINC00526Q96FQ7 95 aa15.04■□□□□ -0
PTPRJ-208ENST00000615445 NDUFS5O43920 106 aa15.04■□□□□ -0
PTPRJ-208ENST00000615445 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa15.04■□□□□ -0
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa15.03■□□□□ -0
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa15.03■□□□□ -0
PTPRJ-208ENST00000615445 CD164L2Q6UWJ8 174 aa15.03■□□□□ -0
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