RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 C11orf52Q96A22 123 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 BCL2L11O43521 198 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 TWIST1Q15672 202 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 C9orf62Q8N4C0 152 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 IFNA1P01562 189 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 SS18Q15532 418 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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PTPRS-208ENST00000590509 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 C5orf38Q86SI9 138 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 CNFNQ9BYD5 112 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 SMLR1H3BR10 107 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.47□□□□□ -0.89
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PTPRS-208ENST00000590509 NUDT11Q96G61 164 aa9.47□□□□□ -0.89
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PTPRS-208ENST00000590509 PMCHP20382 165 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRS-208ENST00000590509 C10orf25Q5T742 122 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRS-208ENST00000590509 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM101Q96IK0 257 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRS-208ENST00000590509 I3L3M4 83 aa9.45□□□□□ -0.9
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PTPRS-208ENST00000590509 C2orf48Q96LS8 159 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRS-208ENST00000590509 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRS-208ENST00000590509 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRS-208ENST00000590509 GNG13Q9P2W3 67 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRS-208ENST00000590509 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRS-208ENST00000590509 SPAG11BQ08648 103 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRS-208ENST00000590509 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRS-208ENST00000590509 XKRY2A2RUG3 117 aa9.42□□□□□ -0.9
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PTPRS-208ENST00000590509 A0A087X002 238 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRS-208ENST00000590509 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.41□□□□□ -0.9
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PTPRS-208ENST00000590509 RNF151Q2KHN1 245 aa9.4□□□□□ -0.9
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PTPRS-208ENST00000590509 M0QXV9 152 aa9.37□□□□□ -0.91
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PTPRS-208ENST00000590509 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
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PTPRS-208ENST00000590509 TEX261Q6UWH6 196 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRS-208ENST00000590509 TSKUQ8WUA8 353 aa9.34□□□□□ -0.91
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PTPRS-208ENST00000590509 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
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PTPRS-208ENST00000590509 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.29□□□□□ -0.92
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