RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 HBDP02042 147 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 GCSHP23434 173 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 PTTG1IPP53801 180 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 UBE2D3P61077 147 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 UBE2D2P62837 147 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 RETNQ9HD89 108 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 K7EP13 123 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 M0QXV9 152 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 UBE2L6O14933 153 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 HTN3P15516 51 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM141Q96I45 108 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.14□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 C20orf202A1L168 122 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 SMKR1H3BMG3 65 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 SERF1AO75920 110 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 AMTP48728 403 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 IQCJQ1A5X6 159 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 Q6ZN92 141 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 Q6ZTC4 211 aa5.13□□□□□ -1.59
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SMAD4-210ENST00000590061 TMEM101Q96IK0 257 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 C2orf88Q9BSF0 95 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM243Q9BU79 118 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 CELA1Q9UNI1 258 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 TENM3Q9P273 2699 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 GAGE12JA6NER3 117 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 CCL25O15444 150 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 LEPROTL1O95214 131 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 CCL18P55774 89 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 GAGE4Q13068 117 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 GAGE5Q13069 117 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.11□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 LINC00694P0DN24 101 aa5.11□□□□□ -1.59
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SMAD4-210ENST00000590061 SEC11AP67812 179 aa5.11□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 LELP1Q5T871 98 aa5.11□□□□□ -1.59
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SMAD4-210ENST00000590061 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
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SMAD4-210ENST00000590061 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.11□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 TIMM17AQ99595 171 aa5.11□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 A0A087WX48 190 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1B0GUV1 79 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 TSHBP01222 138 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 VSIG2Q96IQ7 327 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 COL7A1Q02388 2944 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 A0A0J9YY99 117 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 PRSS1P07477 247 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 P0DMU3 169 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 FAM231AP0DMU4 169 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 FAM231CP0DMU5 169 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 RBX1P62877 108 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 LINC01620Q4KN68 170 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.09□□□□□ -1.59
SMAD4-210ENST00000590061 A0A096LPF7 62 aa5.08□□□□□ -1.6
SMAD4-210ENST00000590061 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.08□□□□□ -1.6
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1B0GV90 55 aa5.08□□□□□ -1.6
SMAD4-210ENST00000590061 IGLL5B9A064 214 aa5.08□□□□□ -1.6
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM262E9PQX1 116 aa5.08□□□□□ -1.6
SMAD4-210ENST00000590061 C3orf84H3BNL1 204 aa5.08□□□□□ -1.6
SMAD4-210ENST00000590061 PMCHL1Q16048 86 aa5.08□□□□□ -1.6
SMAD4-210ENST00000590061 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.08□□□□□ -1.6
SMAD4-210ENST00000590061 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.08□□□□□ -1.6
SMAD4-210ENST00000590061 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SMAD4-210ENST00000590061 GAS8-AS1O95177 125 aa5.07□□□□□ -1.6
SMAD4-210ENST00000590061 FABP4P15090 132 aa5.07□□□□□ -1.6
SMAD4-210ENST00000590061 PLNP26678 52 aa5.07□□□□□ -1.6
SMAD4-210ENST00000590061 PMVKQ15126 192 aa5.07□□□□□ -1.6
SMAD4-210ENST00000590061 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.07□□□□□ -1.6
SMAD4-210ENST00000590061 MUC7Q8TAX7 377 aa5.07□□□□□ -1.6
SMAD4-210ENST00000590061 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
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