RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583826.5

TSPOAP1-AS1-209, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,004 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 HIGD1CA8MV81 97 aa17.78■□□□□ 0.44
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TSKUQ8WUA8 353 aa17.78■□□□□ 0.44
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 C2orf48Q96LS8 159 aa17.49■□□□□ 0.39
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 C9JQL5 133 aa17.48■□□□□ 0.39
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ODF1Q14990 250 aa17.48■□□□□ 0.39
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa17.47■□□□□ 0.39
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 A0A1W2PNN7 141 aa17.47■□□□□ 0.39
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SPAG11BQ08648 103 aa17.47■□□□□ 0.39
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TCAPO15273 167 aa17.46■□□□□ 0.39
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP17.46■□□□□ 0.39
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TNFRSF6BO95407 300 aa17.45■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 RPL32P62910 135 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SMIM2Q9BVW6 85 aa17.44■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 D6R8Y8 96 aa17.43■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PEA15Q15121 130 aa17.43■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
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