RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 A8MZ25 164 aa15.83■□□□□ 0.13
PTPRM-211ENST00000580170 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
PTPRM-211ENST00000580170 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 NRACQ8N912 160 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 CASC2Q6XLA1 102 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 LST1O00453 97 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 TSHBP01222 138 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 C11orf71Q6IPW1 123 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 SMIM26A0A096LP01 95 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 Q6Q795 121 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 A0A096LNI7 61 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 PRR15LQ9BU68 103 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 XAGE1AQ9HD64 81 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 WFDC10BQ8IUB3 73 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 PRR9Q5T870 116 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 DCANP1Q8TF63 244 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 K7ERS5 55 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00482Q8N8I6 264 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 Q8N976 141 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZSV7 163 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 C11orf21Q9P2W6 132 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 C6orf99Q4VX62 202 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRM-211ENST00000580170 CCKP06307 115 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 DSCAML1Q8TD84 2053 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 PRR4Q16378 134 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 Q8N6K4 173 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 A0A087WZ39 114 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 Q6JHZ5 121 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 PLCE1Q9P212 2302 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 HILS1P60008 231 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 MIFP14174 115 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 GAS8-AS1O95177 125 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF702PQ9H963 129 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 C3orf84H3BNL1 204 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 SERP1Q9Y6X1 66 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 C1orf158Q8N1D5 194 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 MED12LQ86YW9 2145 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 PCNX3Q9H6A9 2034 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 IL17DQ8TAD2 202 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 PCDH15Q96QU1 1955 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0J9YWU9 116 aa15.71■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 INAFM1C9JVW0 142 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 KLLNB2CW77 178 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZS46 218 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 SYCNQ0VAF6 134 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 C9orf85Q96MD7 179 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 C18orf65Q6ZTR6 163 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00526Q96FQ7 95 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 PRM2P04554 102 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 CD164L2Q6UWJ8 174 aa15.68■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 UBE2D1P51668 147 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV2D-28P01615 120 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 TECTAO75443 2155 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 SMIM11BQ8TCY0 68 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 PMAIP1Q13794 54 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 WFDC13Q8IUB5 93 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 LRCOL1A6NCL2 159 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 WFDC10AQ9H1F0 79 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZQY7 126 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
PTPRM-211ENST00000580170 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRM-211ENST00000580170 TNCP24821 2201 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV1-40P01703 118 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00310P59036 64 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV7A0A075B6U4 112 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRM-211ENST00000580170 FAM30AQ9NZY2 134 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRM-211ENST00000580170 M0R378 163 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRM-211ENST00000580170 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PTPRM-211ENST00000580170 Q8N9L7 120 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRM-211ENST00000580170 POM121L12Q8N7R1 296 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRM-211ENST00000580170 CNFNQ9BYD5 112 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRM-211ENST00000580170 TANC2Q9HCD6 1990 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRM-211ENST00000580170 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
PTPRM-211ENST00000580170 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa15.58■□□□□ 0.09
PTPRM-211ENST00000580170 LELP1Q5T871 98 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 PPDPFQ9H3Y8 114 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 LINC01006Q8NI28 216 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV10A0A0B4J240 114 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 A0A087WVE0 104 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 IGIPA6NJ69 53 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 159.8 ms