RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566833.1

CCNDBP1-209, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-209ENST00000566833 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.06□□□□□ -0.96
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CCNDBP1-209ENST00000566833 COX11Q9Y6N1 276 aa9.06□□□□□ -0.96
CCNDBP1-209ENST00000566833 RTL8CO15255 209 aa9.05□□□□□ -0.96
CCNDBP1-209ENST00000566833 ENHOQ6UWT2 76 aa9.05□□□□□ -0.96
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.05□□□□□ -0.96
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CCNDBP1-209ENST00000566833 PRR34Q9NV39 138 aa9.05□□□□□ -0.96
CCNDBP1-209ENST00000566833 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CCNDBP1-209ENST00000566833 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.04□□□□□ -0.96
CCNDBP1-209ENST00000566833 LINC00614P0C842 121 aa9.04□□□□□ -0.96
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CCNDBP1-209ENST00000566833 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.04□□□□□ -0.96
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CCNDBP1-209ENST00000566833 RYR3Q15413 4870 aa9.03□□□□□ -0.96
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CCNDBP1-209ENST00000566833 LINC01549A6NIU2 74 aa9.02□□□□□ -0.97
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CCNDBP1-209ENST00000566833 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.02□□□□□ -0.97
CCNDBP1-209ENST00000566833 EREGO14944 169 aa9.01□□□□□ -0.97
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CCNDBP1-209ENST00000566833 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CCNDBP1-209ENST00000566833 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.01□□□□□ -0.97
CCNDBP1-209ENST00000566833 TNP2Q05952 138 aa9□□□□□ -0.97
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CCNDBP1-209ENST00000566833 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.94□□□□□ -0.98
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CCNDBP1-209ENST00000566833 UBE2D1P51668 147 aa8.91□□□□□ -0.98
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CCNDBP1-209ENST00000566833 FOXI1Q12951 378 aa8.91□□□□□ -0.98
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CCNDBP1-209ENST00000566833 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.91□□□□□ -0.98
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