RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551549.1

GCN1-208, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, human

TSL 2

Gene GCN1, Length 258 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCN1-208	ENST00000551549	XCL1	P47992	114 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	COX6A2	Q02221	97 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	ISOC2	Q96AB3	205 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	MRAP2	Q96G30	205 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	TMEM101	Q96IK0	257 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	6.17	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	RIG	Q13278	110 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	NRAC	Q8N912	160 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	BTF3L4	Q96K17	158 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	LRP2	P98164	4655 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	VCY	O14598	125 aa		6.16	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	CCL25	O15444	150 aa		6.16	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	ADIRF	Q15847	76 aa		6.16	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		6.16	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		6.16	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		6.16	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		6.16	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		6.15	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		6.15	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	FCER1G	P30273	86 aa		6.15	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	MAJIN	Q3KP22	176 aa		6.15	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		6.15	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	NAT8	Q9UHE5	227 aa		6.15	□□□□□ -1.42
GCN1-208	ENST00000551549	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		6.14	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		6.14	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	PHOX2A	O14813	284 aa		6.14	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	CAMP	P49913	170 aa		6.14	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	PEA15	Q15121	130 aa		6.14	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	SS18	Q15532	418 aa		6.14	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		6.14	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		6.14	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549		A0A096LNI7	61 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	PPP1R17	O96001	155 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	MT1HL1	P0DM35	61 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	STPG4	Q8N801	248 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	KIR2DL4	Q99706	377 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	PPP1R2P9	O14990	202 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	CKS2	P33552	79 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549		Q6ZRU5	148 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549		Q6ZUT4	128 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	C7orf33	Q8WU49	177 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	CARD19	Q96LW7	228 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	C20orf78	Q9BR46	151 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		6.1	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549		A0A1B0GW15	77 aa		6.1	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		6.1	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549		D6R8Y8	96 aa		6.1	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		6.1	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	COX7A2L	O14548	114 aa		6.1	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	TNFRSF6B	O95407	300 aa		6.1	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	SYCN	Q0VAF6	134 aa		6.1	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		6.1	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		6.09	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549		A0A1B0GXF2	115 aa		6.09	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	LINC00862	A6NCI5	91 aa		6.09	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	MAL	P21145	153 aa		6.09	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	HBB	P68871	147 aa		6.09	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		6.09	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	C5orf38	Q86SI9	138 aa		6.09	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	FAM104A	Q969W3	186 aa		6.09	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		6.09	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		6.09	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549	RNF213	Q63HN8	5207 aa		6.09	□□□□□ -1.43
GCN1-208	ENST00000551549		F8W036	122 aa		6.08	□□□□□ -1.44
GCN1-208	ENST00000551549	TCAP	O15273	167 aa		6.08	□□□□□ -1.44
GCN1-208	ENST00000551549	NPY	P01303	97 aa		6.08	□□□□□ -1.44
GCN1-208	ENST00000551549	TMEM18	Q96B42	140 aa		6.08	□□□□□ -1.44
GCN1-208	ENST00000551549	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
GCN1-208	ENST00000551549	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		6.08	□□□□□ -1.44
GCN1-208	ENST00000551549	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		6.08	□□□□□ -1.44
GCN1-208	ENST00000551549	S100A8	P05109	93 aa		6.07	□□□□□ -1.44
GCN1-208	ENST00000551549	PTTG1IP	P53801	180 aa		6.07	□□□□□ -1.44
GCN1-208	ENST00000551549	GAGE2B	Q13066	116 aa		6.07	□□□□□ -1.44
GCN1-208	ENST00000551549	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		6.07	□□□□□ -1.44
GCN1-208	ENST00000551549	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		6.06	□□□□□ -1.44
GCN1-208	ENST00000551549	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		6.06	□□□□□ -1.44
GCN1-208	ENST00000551549	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		6.06	□□□□□ -1.44
GCN1-208	ENST00000551549		A0A0J9YXV3	536 aa		6.05	□□□□□ -1.44
GCN1-208	ENST00000551549		A0A1W2PNN7	141 aa		6.05	□□□□□ -1.44
GCN1-208	ENST00000551549	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
GCN1-208	ENST00000551549	APOM	O95445	188 aa		6.05	□□□□□ -1.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms