RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529667.1

SOX9-AS1-208, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 340 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RAB37Q96AX2 223 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ERG28Q9UKR5 140 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SHISA2Q6UWI4 295 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LINC00482Q8N8I6 264 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 WNK1Q9H4A3 2382 aa4.85□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMEM262E9PQX1 116 aa4.85□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 CFC1P0CG37 223 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SCGB1A1P11684 91 aa4.85□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 WFDC9Q8NEX5 89 aa4.85□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCDC168Q8NDH2 2452 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FASNP49327 2511 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FBN2P35556 2912 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.84□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MIFP14174 115 aa4.84□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RBX1P62877 108 aa4.84□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ATXN8Q156A1 80 aa4.84□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SBSPONQ8IVN8 264 aa4.84□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 VPS25Q9BRG1 176 aa4.84□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRO0255Q9UI72 69 aa4.84□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.83□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 A0A1W2PRX2 142 aa4.83□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 A8MZ25 164 aa4.83□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 Q6ZTI0 123 aa4.83□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MTURNQ8N3F0 131 aa4.83□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CARD19Q96LW7 228 aa4.83□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.83□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 UNC79Q9P2D8 2635 aa4.82□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SONP18583 2426 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PDZD2O15018 2839 aa4.82□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.82□□□□□ -1.64
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 H3BNG1 76 aa4.82□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CRLF1O75462 422 aa4.82□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IGHV3-33P01772 117 aa4.82□□□□□ -1.64
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.82□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM222AQ5U5X8 452 aa4.82□□□□□ -1.64
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM104AQ969W3 186 aa4.82□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa4.81□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.81□□□□□ -1.64
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.81□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.81□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 H3BT86 120 aa4.81□□□□□ -1.64
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 TSPAN13O95857 204 aa4.81□□□□□ -1.64
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 PSMB2P49721 201 aa4.81□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 COX17Q14061 63 aa4.81□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FHL2Q14192 279 aa4.81□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SS18Q15532 418 aa4.81□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.81□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 Q6ZSN1 163 aa4.81□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TEN1Q86WV5 123 aa4.81□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.81□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.81□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ITPR2Q14571 2701 aa4.8□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
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SOX9-AS1-208ENST00000529667 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 H3BQ85 93 aa4.8□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.8□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 Q6ZUT4 128 aa4.8□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.8□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BAHCC1Q9P281 2608 aa4.8□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GAGE12JA6NER3 117 aa4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GAGE7O76087 117 aa4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GAGE12FP0CL80 117 aa4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GAGE12GP0CL81 117 aa4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GAGE12IP0CL82 117 aa4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SPART-AS1P0CW21 52 aa4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EMP1P54849 157 aa4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FOXI1Q12951 378 aa4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GAGE4Q13068 117 aa4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GAGE5Q13069 117 aa4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.79□□□□□ -1.64
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