RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513346.5

TCOF1-211, Transcript of treacle ribosome biogenesis factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TCOF1, Length 4,646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1-211ENST00000513346 FSTL3O95633 263 aa8.44□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 C20orf197Q8N268 126 aa8.44□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 COL6A3P12111 3177 aa8.44□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.44□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.44□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 CCDC140Q96MF4 163 aa8.44□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 TRANK1O15050 2925 aa8.44□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.44□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.44□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.43□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 K7EMT4 169 aa8.43□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 GPHB5Q86YW7 130 aa8.43□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.43□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 MAST4O15021 2626 aa8.43□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 A6NDX4 124 aa8.43□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 CXCL5P42830 114 aa8.43□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.43□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.43□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 C5orf38Q86SI9 138 aa8.43□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.43□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.42□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.42□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 FAM236CP0DP71 79 aa8.42□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 TMEM89A2RUT3 159 aa8.42□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 AGRNO00468 2067 aa8.42□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.42□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.42□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 ZNF292O60281 2723 aa8.42□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 TIMM17BO60830 172 aa8.41□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.41□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.41□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.41□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 PRO0461Q9UI25 63 aa8.41□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 A0A0J9YX75 114 aa8.41□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.41□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 BRK1Q8WUW1 75 aa8.41□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 M0QY20 66 aa8.41□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 ODF3BA8MYP8 253 aa8.4□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 CDSNQ15517 529 aa8.4□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 RNF152Q8N8N0 203 aa8.4□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 C20orf173Q96LM9 149 aa8.4□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 IGIPA6NJ69 53 aa8.4□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 USP17L23D6RBM5 183 aa8.4□□□□□ -1.06
TCOF1-211ENST00000513346 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.4□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 LY6LH3BQJ8 138 aa8.4□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.4□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 ATRQ13535 2644 aa8.4□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.39□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.39□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 NDUFA1O15239 70 aa8.39□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.39□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 XCL1P47992 114 aa8.39□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.39□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 TRBV12-3P01733 135 aa8.39□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 LINC01548A6NM66 108 aa8.39□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 TIRAPP58753 221 aa8.39□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.39□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 UPK3BQ9BT76 320 aa8.39□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 MGAQ8IWI9 3026 aa8.38□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 K7EQD1 137 aa8.38□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 RMI2Q96E14 147 aa8.38□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.38□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.38□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 C16orf74Q96GX8 76 aa8.38□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 USP34Q70CQ2 3546 aa8.37□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 IGHV4-31P0DP07 118 aa8.37□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 PRR9Q5T870 116 aa8.37□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.37□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.37□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 ODF3Q96PU9 254 aa8.37□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 H3BQ85 93 aa8.36□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.36□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 F8WEM9 126 aa8.36□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 TSHBP01222 138 aa8.36□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.36□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.36□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 A8MZ25 164 aa8.36□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.36□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 EBI3Q14213 229 aa8.35□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.35□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 GYPEP15421 78 aa8.35□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 PDE6GP18545 87 aa8.35□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.35□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 INAFM1C9JVW0 142 aa8.35□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 ENHOQ6UWT2 76 aa8.35□□□□□ -1.07
TCOF1-211ENST00000513346 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms