RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	CRYGD	P07320	174 aa		5.97	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		5.97	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		5.97	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		5.97	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		5.97	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		5.96	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		5.96	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	DCANP1	Q8TF63	244 aa		5.96	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	TSHB	P01222	138 aa		5.96	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		5.96	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM126A	Q9H061	195 aa		5.96	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	KLK12	Q9UKR0	248 aa		5.96	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	TRIAP1	O43715	76 aa		5.96	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	INSL3	P51460	131 aa		5.96	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		5.96	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		5.96	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	ZMAT4	Q9H898	229 aa		5.96	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		5.95	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		5.95	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		5.95	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV1-40	P01703	118 aa		5.95	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZSV7	163 aa		5.95	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	PRO0255	Q9UI72	69 aa		5.95	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		5.95	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		5.95	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	TRAC	P01848	142 aa		5.94	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	RNF183	Q96D59	192 aa		5.94	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	PTPRB	P23467	1997 aa		5.94	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	NCR3	O14931	201 aa		5.94	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	SPAG11B	Q08648	103 aa		5.94	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		5.94	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		5.94	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	MRAP	Q8TCY5	172 aa		5.94	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GX51	115 aa		5.94	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	IGIP	A6NJ69	53 aa		5.94	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	C9orf85	Q96MD7	179 aa		5.94	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF702P	Q9H963	129 aa		5.93	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		5.93	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		5.93	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		5.93	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	SPANXC	Q9NY87	97 aa		5.93	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		5.93	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		5.92	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		5.92	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		5.92	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		5.92	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		5.92	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	TIRAP	P58753	221 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	CENPE	Q02224	2701 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		5.9	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		5.9	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	hADV29S1	A0JD25	119 aa		5.9	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFA1	O15239	70 aa		5.9	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	SLPI	P03973	132 aa		5.9	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00643	Q86TS7	51 aa		5.9	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		5.9	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		5.9	□□□□□ -1.46
NEK1-208	ENST00000512193	MUC4	Q99102	2169 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	ATOX1	O00244	68 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		5.89	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		5.89	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFA7	O95182	113 aa		5.89	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	CXCL5	P42830	114 aa		5.89	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		5.89	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	XG	P55808	180 aa		5.89	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2B	P63146	152 aa		5.89	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF580	Q9UK33	172 aa		5.89	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		5.88	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	REG3A	Q06141	175 aa		5.88	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2D1	P51668	147 aa		5.88	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		5.88	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		5.88	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01006	Q8NI28	216 aa		5.88	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	RMI2	Q96E14	147 aa		5.88	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		5.88	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP10-9	P60411	292 aa		5.88	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	TRIO	O75962	3097 aa		5.87	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		5.87	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		5.87	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		5.87	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		5.87	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	DIRC1	Q969H9	104 aa		5.87	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		5.87	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	CDK2AP2	O75956	126 aa		5.87	□□□□□ -1.47
NEK1-208	ENST00000512193	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47

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