RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 TM2D2Q9BX73 214 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 X6R8D5 127 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM223A0PJW6 202 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF815PA8K554 130 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 GCSHP23434 173 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 GAGE12JA6NER3 117 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 H3BRM9 83 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 FXYD2P54710 66 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 GAGE4Q13068 117 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 GAGE5Q13069 117 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 GAGE13Q4V321 117 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 FHL2Q14192 279 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 Q6ZUT4 128 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 J3QQQ9 107 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 LEPROTO15243 131 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 K7EP13 123 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 APOC4P55056 127 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 OXLD1Q5BKU9 147 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 HIST1H4GQ99525 98 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 UBE2V1Q13404 147 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 C9orf118A6NHY6 69 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00694P0DN24 101 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 UBE2D1P51668 147 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 PTTG1IPP53801 180 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0J9YY99 117 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 SMIM13P0DJ93 91 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB130BP0DP73 79 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB130AP0DP74 79 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 VAMP3Q15836 100 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB135Q30KP9 77 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 LYRM9A8MSI8 78 aa5.77□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 G3V4G9 280 aa5.77□□□□□ -1.48
PDE4D-208ENST00000502484 H7C423 109 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 CCL25O15444 150 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 TIRAPP58753 221 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM243Q9BU79 118 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 FAM222AQ5U5X8 452 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 RAB37Q96AX2 223 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 H3BUT2 72 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 UBE2L6O14933 153 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GWB2 263 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 C12orf74Q32Q52 190 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 K7ERJ3 54 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 MIFP14174 115 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 HERVK_113P63121 156 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 Q8NAQ8 132 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 VSIG2Q96IQ7 327 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 PRO0255Q9UI72 69 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV3-30P01768 117 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 RNF183Q96D59 192 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM101Q96IK0 257 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 DNAH3Q8TD57 4116 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PPM0 123 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 SPINK8P0C7L1 97 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 COX6A2Q02221 97 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 FBN3Q75N90 2809 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 GYPEP15421 78 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0J9YXY3 114 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB4AO15263 64 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa5.73□□□□□ -1.49
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