RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 LEPROTO15243 131 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 GNRH2O43555 120 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 BGLAPP02818 100 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 NPPCP23582 126 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 SYCNQ0VAF6 134 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 AGRNO00468 2067 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 F8P00451 2351 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC01548A6NM66 108 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 ORMDL3Q8N138 153 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 CFC1BP0CG36 223 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 CFC1P0CG37 223 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 Q8N1X5 172 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 Q8N6K4 173 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC01560Q8TB33 94 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 COX6B1P14854 86 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 FXYD7P58549 80 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP10-9P60411 292 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 BSPH1Q075Z2 132 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 FHL1Q13642 323 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF525Q8N782 197 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 LIMD2Q9BT23 127 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 IGLV2-8P01709 118 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV1-2P23083 117 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 Q6ZPA2 131 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 UBALD1Q8TB05 177 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 MED13LQ71F56 2210 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A1W2PPR1 153 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 H7C423 109 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 PRSS1P07477 247 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 PRSS2P07478 247 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF815PA8K554 130 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-214ENST00000497648 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.21□□□□□ -1.414e-10■■■□□ 15.1
RABGGTB-214ENST00000497648 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV1D-12P01611 117 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV3-48P01763 117 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV3-33P01772 117 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV4-59P01825 116 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 DKK2Q9UBU2 259 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 ZFHX3Q15911 3703 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC01546A6NGU7 62 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 HCG22E2RYF7 251 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 DNAL4O96015 105 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 EDDM3BP56851 147 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM104AQ969W3 186 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 NF1P21359 2839 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 hDV103S1A0JD37 113 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 C16orf90A8MZG2 172 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 E7EUB6 86 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 PATE4P0C8F1 98 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.5 ms