RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	PRSS1	P07477	247 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ESD	P10768	282 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	MAL	P21145	153 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	S100P	P25815	95 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	XCL1	P47992	114 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TTLL3-231	ENST00000496246	RYR1	P21817	5038 aa		7.4	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC01620	Q4KN68	170 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	NRAC	Q8N912	160 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	PRELID3A	Q96N28	172 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GXF2	115 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	GAS8-AS1	O95177	125 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	APOM	O95445	188 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	G0S2	P27469	103 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	HAMP	P81172	84 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246		Q6ZSA8	131 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	IMMP2L	Q96T52	175 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	HSPG2	P98160	4391 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM218	A2RU14	115 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	SCX	Q7RTU7	201 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	COX7A2L	O14548	114 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	NPY	P01303	97 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	COX19	Q49B96	90 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246		Q6ZN92	141 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	COMMD7	Q86VX2	200 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	SEC11C	Q9BY50	192 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246		K7EMI3	77 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	FOXI1	Q12951	378 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	NDUFA5	Q16718	116 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TTLL3-231	ENST00000496246	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	C15orf56	Q8N910	161 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	IFITM10	A6NMD0	228 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	CARD19	Q96LW7	228 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	SYCN	Q0VAF6	134 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246		Q6ZUT4	128 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246		Q8N8P6	123 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	C7orf33	Q8WU49	177 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC01549	A6NIU2	74 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	PRSS47	A8MTI9	375 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	COX6A2	Q02221	97 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	RHEB	Q15382	184 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM141	Q96I45	108 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246		F8WDY8	70 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246		J3QL48	77 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	MT-ND6	P03923	174 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	IFITM2	Q01629	132 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	MAJIN	Q3KP22	176 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	VCX2	Q9H322	139 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		7.29	□□□□□ -1.24

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