RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 FOXI1Q12951 378 aa6.78□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 PEA15Q15121 130 aa6.78□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.78□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.78□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 MRAP2Q96G30 205 aa6.78□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.78□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
NELFE-213ENST00000494956 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.77□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.77□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 H7C423 109 aa6.77□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 CCL25O15444 150 aa6.77□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 XCL1P47992 114 aa6.77□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.77□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.77□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 MYCBP2O75592 4640 aa6.77□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.76□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.76□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.76□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 TMEM101Q96IK0 257 aa6.76□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 BTF3L4Q96K17 158 aa6.76□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 COX6A2Q02221 97 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 DPH3Q96FX2 82 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 A0A087WYN8 130 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 VCYO14598 125 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 FCER1GP30273 86 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 CFAP161Q6P656 301 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 HERC1Q15751 4861 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 A0A1B0GXF2 115 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 D6R8Y8 96 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 NPYP01303 97 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 Q6ZUT4 128 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 TNFRSF6BO95407 300 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 CKS2P33552 79 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 HBBP68871 147 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 SS18Q15532 418 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 FAM104AQ969W3 186 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 KIR2DL4Q99706 377 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-213ENST00000494956 A0A096LNI7 61 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 TCAPO15273 167 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 MAJINQ3KP22 176 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 LINC00862A6NCI5 91 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 PPP1R2P9O14990 202 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 PPP1R17O96001 155 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 A0A1B0GW15 77 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 PHOX2AO14813 284 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 C5orf38Q86SI9 138 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 CARD19Q96LW7 228 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 C20orf78Q9BR46 151 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 F8W036 122 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 Q6ZRU5 148 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 STPG4Q8N801 248 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 COX7A2LO14548 114 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 MALP21145 153 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 SYCNQ0VAF6 134 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 PRELID3AQ96N28 172 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 A0A0J9YXV3 536 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 S100A8P05109 93 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 RAB14P61106 215 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 IFITM2Q01629 132 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 ORMDL3Q8N138 153 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 TMEM18Q96B42 140 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-213ENST00000494956 OXTP01178 125 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.7 ms