RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 VCX2Q9H322 139 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 VWFP04275 2813 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 CCDC179H3BU77 68 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 STHQ8IWL8 128 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 WFDC10AQ9H1F0 79 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 PLA2G2AP14555 144 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 NPC2P61916 151 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 TEX29Q8N6K0 151 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 AMELXQ99217 191 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 SMR3AQ99954 134 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 A4D1N5 150 aa9.27□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A20O43772 301 aa9.27□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.27□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 EDA2RQ9HAV5 297 aa9.27□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 TMEM223A0PJW6 202 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 Q1RN00 199 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 BEAN1Q3B7T3 259 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 J3QKU1 62 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 RHODO00212 210 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-53P01767 116 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 SPXQ9BT56 116 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 LEPROTO15243 131 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 RS1O15537 224 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZTI0 123 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 SMIM20Q8N5G0 67 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 TTC32Q5I0X7 151 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 GAGE5Q13069 117 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 GAGE6Q13070 117 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 TENM1Q9UKZ4 2725 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 C16orf95Q9H693 158 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 A8MZ25 164 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 SNCGO76070 127 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 GAGE2BQ13066 116 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 GAGE2EQ4V326 116 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 CITED1Q99966 193 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 PRSS2P07478 247 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 HERV-K104P63124 156 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 IL17DQ8TAD2 202 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PRAME-213ENST00000492657 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.21□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 A0A0J9YXY3 114 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-33P01772 117 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 IGLV1-51P01701 117 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 LINC00694P0DN24 101 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 HILS1P60008 231 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP10-3P60369 221 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 CLEC2BQ92478 149 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 NDUFA7O95182 113 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 DAND5Q8N907 189 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 GAGE12JA6NER3 117 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 TRIAP1O43715 76 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 GAGE4Q13068 117 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 ATRQ13535 2644 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 GAGE7O76087 117 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 GAGE12FP0CL80 117 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 GAGE12GP0CL81 117 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 GAGE12IP0CL82 117 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 A0A0B4J2C4 111 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.4 ms