RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-222ENST00000491867 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-222ENST00000491867 I3L3M4 83 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM101Q96IK0 257 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-222ENST00000491867 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 CCL25O15444 150 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 BTF3L4Q96K17 158 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 CARD19Q96LW7 228 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 TSHBP01222 138 aa8.38□□□□□ -1.07
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ATG4B-222ENST00000491867 PMCHP20382 165 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 SLC51BQ86UW2 128 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 MRAP2Q96G30 205 aa8.38□□□□□ -1.07
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ATG4B-222ENST00000491867 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.37□□□□□ -1.07
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ATG4B-222ENST00000491867 SS18Q15532 418 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 C1orf137Q5JT78 98 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 DIRC1Q969H9 104 aa8.36□□□□□ -1.07
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ATG4B-222ENST00000491867 ST20Q9HBF5 79 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM250H0YL14 139 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 CT83Q5H943 113 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 A0A1W2PNN7 141 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 CAMPP49913 170 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 PTTG1IPP53801 180 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 BORCS7Q96B45 105 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 MUC17Q685J3 4493 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-222ENST00000491867 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.33□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.33□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.32□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 A0A1B0GUT8 65 aa8.32□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 HIGD1CA8MV81 97 aa8.32□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 GAGE2BQ13066 116 aa8.32□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 ISOC2Q96AB3 205 aa8.32□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.31□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.31□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 H0Y9J4 135 aa8.31□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 IGLV7-43P04211 117 aa8.31□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 RAB4AP20338 218 aa8.31□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 MALP21145 153 aa8.31□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 TSKUQ8WUA8 353 aa8.31□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 COX7A2LO14548 114 aa8.3□□□□□ -1.08
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ATG4B-222ENST00000491867 AMN1Q8IY45 258 aa8.3□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 NUP35Q8NFH5 326 aa8.3□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 APOMO95445 188 aa8.29□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.29□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 FCER1GP30273 86 aa8.29□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 UBE2D1P51668 147 aa8.29□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 BLOC1S1P78537 153 aa8.29□□□□□ -1.08
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ATG4B-222ENST00000491867 LINC01551Q86U37 167 aa8.29□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.29□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 SMKR1H3BMG3 65 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 VCYO14598 125 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 TSPAN13O95857 204 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 SMIM7Q9BQ49 75 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.28□□□□□ -1.08
ATG4B-222ENST00000491867 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 NRACQ8N912 160 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 C2orf48Q96LS8 159 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 OSTCQ9NRP0 149 aa8.27□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 PPP1R17O96001 155 aa8.26□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 Q6ZUT4 128 aa8.26□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 KIR2DL4Q99706 377 aa8.26□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 SPAG11BQ08648 103 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 C5orf38Q86SI9 138 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 A0A087WZ39 114 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF727A8MUV8 499 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 RIGQ13278 110 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 V9GYV3 84 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 PPP1R2P9O14990 202 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-222ENST00000491867 RNF151Q2KHN1 245 aa8.23□□□□□ -1.09
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