RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490140.1

FDPS-215, Transcript of farnesyl diphosphate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene FDPS, Length 680 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPS-215ENST00000490140 FOXI1Q12951 378 aa7.36□□□□□ -1.23
FDPS-215ENST00000490140 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.36□□□□□ -1.23
FDPS-215ENST00000490140 BORCS7Q96B45 105 aa7.36□□□□□ -1.23
FDPS-215ENST00000490140 NUDT11Q96G61 164 aa7.36□□□□□ -1.23
FDPS-215ENST00000490140 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.35□□□□□ -1.23
FDPS-215ENST00000490140 CCL25O15444 150 aa7.35□□□□□ -1.23
FDPS-215ENST00000490140 SYCNQ0VAF6 134 aa7.35□□□□□ -1.23
FDPS-215ENST00000490140 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.34□□□□□ -1.23
FDPS-215ENST00000490140 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.34□□□□□ -1.23
FDPS-215ENST00000490140 FAM231BA6NCW3 169 aa7.34□□□□□ -1.23
FDPS-215ENST00000490140 PRSS47A8MTI9 375 aa7.34□□□□□ -1.23
FDPS-215ENST00000490140 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.34□□□□□ -1.23
FDPS-215ENST00000490140 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
FDPS-215ENST00000490140 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.33□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 A8MWL6 223 aa7.33□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 MALP21145 153 aa7.33□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 CAMPP49913 170 aa7.33□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 ST20Q9HBF5 79 aa7.33□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 PTTG1IPP53801 180 aa7.32□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 KRTAP10-8P60410 259 aa7.32□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 ODF1Q14990 250 aa7.32□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 SLC51BQ86UW2 128 aa7.32□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.31□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.31□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.31□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 TSKUQ8WUA8 353 aa7.31□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.3□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 COX7A2LO14548 114 aa7.3□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 APOMO95445 188 aa7.3□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 PPP1R17O96001 155 aa7.3□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 MT-ND6P03923 174 aa7.3□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 S100A6P06703 90 aa7.3□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 RAB14P61106 215 aa7.3□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 GAGE2BQ13066 116 aa7.3□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 CT83Q5H943 113 aa7.3□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.3□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.3□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 TMEM250H0YL14 139 aa7.29□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 TSHBP01222 138 aa7.29□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 ESDP10768 282 aa7.29□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 FCER1GP30273 86 aa7.29□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.29□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.29□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.29□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.28□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 A0A1B0GUT8 65 aa7.28□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 K7EN84 100 aa7.28□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.28□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 OCC1Q8TAD7 63 aa7.28□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 TMEM18Q96B42 140 aa7.28□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 C2orf48Q96LS8 159 aa7.28□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 KIR2DL4Q99706 377 aa7.28□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.28□□□□□ -1.24
FDPS-215ENST00000490140 IFITM2Q01629 132 aa7.27□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.27□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 VCYO14598 125 aa7.26□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 NUP35Q8NFH5 326 aa7.26□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 DIRC1Q969H9 104 aa7.26□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 HIGD1CA8MV81 97 aa7.25□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 F8WDY8 70 aa7.25□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 PPP1R2P9O14990 202 aa7.25□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 TCAPO15273 167 aa7.25□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 GAS8-AS1O95177 125 aa7.25□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 C1orf137Q5JT78 98 aa7.25□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.25□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 SPAG11BQ08648 103 aa7.24□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 RNF151Q2KHN1 245 aa7.24□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 IMMP2LQ96T52 175 aa7.24□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.23□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 CEBPGP53567 150 aa7.23□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 BLOC1S1P78537 153 aa7.23□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 RIGQ13278 110 aa7.23□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 CLLU1Q5K131 121 aa7.23□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.23□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.22□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 RAB4AP20338 218 aa7.22□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.22□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.22□□□□□ -1.25
FDPS-215ENST00000490140 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.21□□□□□ -1.26
FDPS-215ENST00000490140 A0A1W2PNN7 141 aa7.21□□□□□ -1.26
FDPS-215ENST00000490140 NDUFA1O15239 70 aa7.21□□□□□ -1.26
FDPS-215ENST00000490140 ALKAL2Q6UX46 152 aa7.21□□□□□ -1.26
FDPS-215ENST00000490140 AMN1Q8IY45 258 aa7.21□□□□□ -1.26
FDPS-215ENST00000490140 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
FDPS-215ENST00000490140 A0A087WZ39 114 aa7.2□□□□□ -1.26
FDPS-215ENST00000490140 IGLV7-43P04211 117 aa7.2□□□□□ -1.26
FDPS-215ENST00000490140 C5orf38Q86SI9 138 aa7.2□□□□□ -1.26
FDPS-215ENST00000490140 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.2□□□□□ -1.26
FDPS-215ENST00000490140 OSTCQ9NRP0 149 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms