RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 KIR2DL4Q99706 377 aa9.18□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 PRSS1P07477 247 aa9.17□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 HAMPP81172 84 aa9.17□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 ORMDL3Q8N138 153 aa9.17□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.17□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 BTF3L4Q96K17 158 aa9.17□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.17□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.16□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 TMEM101Q96IK0 257 aa9.16□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 IMMP2LQ96T52 175 aa9.16□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.16□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
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SRRT-210ENST00000477529 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.15□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
SRRT-210ENST00000477529 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.15□□□□□ -0.94
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SRRT-210ENST00000477529 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.14□□□□□ -0.95
SRRT-210ENST00000477529 C15orf56Q8N910 161 aa9.14□□□□□ -0.95
SRRT-210ENST00000477529 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
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SRRT-210ENST00000477529 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.13□□□□□ -0.95
SRRT-210ENST00000477529 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.13□□□□□ -0.95
SRRT-210ENST00000477529 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-210ENST00000477529 hDV102S1A0JD36 115 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-210ENST00000477529 FOXI1Q12951 378 aa9.12□□□□□ -0.95
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SRRT-210ENST00000477529 Q6ZUT4 128 aa9.12□□□□□ -0.95
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SRRT-210ENST00000477529 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-210ENST00000477529 PRSS47A8MTI9 375 aa9.11□□□□□ -0.95
SRRT-210ENST00000477529 CCL25O15444 150 aa9.11□□□□□ -0.95
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SRRT-210ENST00000477529 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-210ENST00000477529 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-210ENST00000477529 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
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SRRT-210ENST00000477529 SS18Q15532 418 aa9.09□□□□□ -0.95
SRRT-210ENST00000477529 Q5VSD8 79 aa9.09□□□□□ -0.95
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SRRT-210ENST00000477529 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.08□□□□□ -0.96
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SRRT-210ENST00000477529 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.08□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.08□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 S100PP25815 95 aa9.07□□□□□ -0.96
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SRRT-210ENST00000477529 RPS10P5Q9NQ39 176 aa9.07□□□□□ -0.96
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SRRT-210ENST00000477529 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.06□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.06□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.06□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.05□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.05□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 APOC3P02656 99 aa9.05□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.05□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.04□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 PANO1I0J062 215 aa9.04□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.04□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.04□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.04□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
SRRT-210ENST00000477529 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.03□□□□□ -0.96
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SRRT-210ENST00000477529 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.03□□□□□ -0.96
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SRRT-210ENST00000477529 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.02□□□□□ -0.97
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SRRT-210ENST00000477529 MT-ND6P03923 174 aa9.02□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 NDUFA5Q16718 116 aa9.02□□□□□ -0.97
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SRRT-210ENST00000477529 FAM229AH3BQW9 127 aa9.01□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 COX7A2LO14548 114 aa9.01□□□□□ -0.97
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SRRT-210ENST00000477529 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.01□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 MYCBP2O75592 4640 aa9.01□□□□□ -0.97
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