RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442670.5

UBE2E1-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E1, human

TSL 2

Gene UBE2E1, Length 622 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2E1-204	ENST00000442670	RHOD	O00212	210 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBE2E1-204	ENST00000442670	VCY	O14598	125 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBE2E1-204	ENST00000442670	RS1	O15537	224 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBE2E1-204	ENST00000442670	MGP	P08493	103 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBE2E1-204	ENST00000442670	UBE2D1	P51668	147 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBE2E1-204	ENST00000442670	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBE2E1-204	ENST00000442670	TIMM17A	Q99595	171 aa		11.4	□□□□□ -0.58
UBE2E1-204	ENST00000442670		A0A087WWL8	130 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	ZNF815P	A8K554	130 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	LYRM9	A8MSI8	78 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	RETN	Q9HD89	108 aa		11.39	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		11.38	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670		M0QXV9	152 aa		11.38	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	EMP1	P54849	157 aa		11.38	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	PMVK	Q15126	192 aa		11.38	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		11.38	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		11.38	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		11.38	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		11.37	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	11.37	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	ZNF56	Q15929	161 aa		11.37	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		11.37	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		11.37	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	C11orf86	A6NJI1	115 aa		11.36	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	GAGE7	O76087	117 aa		11.36	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	GAGE12F	P0CL80	117 aa		11.36	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	GAGE12G	P0CL81	117 aa		11.36	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	GAGE12I	P0CL82	117 aa		11.36	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	ETDB	Q3ZM63	59 aa		11.36	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	KIR2DL4	Q99706	377 aa		11.36	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		11.36	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		11.36	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		11.35	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670		F5H697	171 aa		11.35	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	APOM	O95445	188 aa		11.35	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	UBE2D3	P61077	147 aa		11.35	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	UBE2D2	P62837	147 aa		11.35	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		11.35	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		11.35	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		11.35	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	NACA	E9PAV3	2078 aa		11.34	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	IGIP	A6NJ69	53 aa		11.34	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	FOXI1	Q12951	378 aa		11.34	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	RHOH	Q15669	191 aa		11.34	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		11.34	□□□□□ -0.59
UBE2E1-204	ENST00000442670	DEFB4A	O15263	64 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670		A0A0J9YY99	117 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670		M0QY20	66 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	IGHV3-53	P01767	116 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	DEFB130B	P0DP73	79 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	DEFB130A	P0DP74	79 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	NFE4	Q86UQ8	179 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	TMEM262	E9PQX1	116 aa		11.31	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	TSPAN13	O95857	204 aa		11.31	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	B9D2	Q9BPU9	175 aa		11.31	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	CELA1	Q9UNI1	258 aa		11.31	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		11.3	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	DAD1	P61803	113 aa		11.3	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	LEPROT	O15243	131 aa		11.29	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	PSMB2	P49721	201 aa		11.29	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	TEN1	Q86WV5	123 aa		11.29	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		11.29	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		11.29	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		11.28	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	IGHV3-30	P01768	117 aa		11.28	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		11.28	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	CRYBA4	P53673	196 aa		11.28	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670		Q6ZSN1	163 aa		11.28	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		11.28	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		11.28	□□□□□ -0.6
UBE2E1-204	ENST00000442670	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		11.27	□□□□□ -0.61
UBE2E1-204	ENST00000442670	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		11.27	□□□□□ -0.61
UBE2E1-204	ENST00000442670	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		11.27	□□□□□ -0.61
UBE2E1-204	ENST00000442670		K7EQD1	137 aa		11.27	□□□□□ -0.61
UBE2E1-204	ENST00000442670	TSHB	P01222	138 aa		11.27	□□□□□ -0.61
UBE2E1-204	ENST00000442670	FHL2	Q14192	279 aa		11.27	□□□□□ -0.61
UBE2E1-204	ENST00000442670	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		11.27	□□□□□ -0.61
UBE2E1-204	ENST00000442670	LINC01600	Q96MT4	127 aa		11.27	□□□□□ -0.61
UBE2E1-204	ENST00000442670	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		11.27	□□□□□ -0.61
UBE2E1-204	ENST00000442670		A0A0J9YWU9	116 aa		11.26	□□□□□ -0.61
UBE2E1-204	ENST00000442670		J3QQQ9	107 aa		11.26	□□□□□ -0.61
UBE2E1-204	ENST00000442670		P0DMU3	169 aa		11.26	□□□□□ -0.61
UBE2E1-204	ENST00000442670	FAM231A	P0DMU4	169 aa		11.26	□□□□□ -0.61
UBE2E1-204	ENST00000442670	FAM231C	P0DMU5	169 aa		11.26	□□□□□ -0.61

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