RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 GAGE5Q13069 117 aa4.26□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 RIGQ13278 110 aa4.26□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 PYY3Q5JQD4 70 aa4.26□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 COX8CQ7Z4L0 72 aa4.26□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 PTH2Q96A98 100 aa4.26□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 KCNS1Q96KK3 526 aa4.26□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 PGLYRP4Q96LB8 373 aa4.26□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.26□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 SAMD10Q9BYL1 202 aa4.26□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 JPT2Q9H910 190 aa4.26□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1B0GUT8 65 aa4.25□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 CIDEAO60543 219 aa4.25□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 SH2D1AO60880 128 aa4.25□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 OXTP01178 125 aa4.25□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 ESDP10768 282 aa4.25□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 FABP4P15090 132 aa4.25□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 CAMPP49913 170 aa4.25□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.25□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.25□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 BAGE3Q86Y29 109 aa4.25□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM18Q96B42 140 aa4.25□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 A0A087WWL8 130 aa4.24□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.24□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.24□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.24□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 CRIP1P50238 77 aa4.24□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 TPPP3Q9BW30 176 aa4.24□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 F2Z2F3 143 aa4.24□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 TRIAP1O43715 76 aa4.24□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.24□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 NIT1Q86X76 327 aa4.24□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.24□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 GTSF1Q8WW33 167 aa4.24□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.23□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa4.23□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1B0GXF2 115 aa4.23□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 F5H697 171 aa4.23□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 MT1HL1P0DM35 61 aa4.23□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 GZMBP10144 247 aa4.23□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.23□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 ZFP2Q6ZN57 461 aa4.23□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 SMIM15Q7Z3B0 74 aa4.23□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 Q8N976 141 aa4.23□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 KLK12Q9UKR0 248 aa4.23□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 GRIFINA4D1Z8 144 aa4.22□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 PANO1I0J062 215 aa4.22□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 NUPR1O60356 82 aa4.22□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 TWIST1Q15672 202 aa4.22□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.22□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 UBE2WQ96B02 151 aa4.22□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 A8MWV9 139 aa4.21□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 ARMS2P0C7Q2 107 aa4.21□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 ENHOQ6UWT2 76 aa4.21□□□□□ -1.73
HOXD8-202ENST00000429017 H3BVH4 76 aa4.21□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 SERF1AO75920 110 aa4.21□□□□□ -1.74
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HOXD8-202ENST00000429017 S100A4P26447 101 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 SSTP61278 116 aa4.21□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 PKIAP61925 76 aa4.21□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 CACNG7P62955 275 aa4.21□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 IQCJQ1A5X6 159 aa4.21□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.21□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 GATD1Q8NB37 220 aa4.21□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 RMI2Q96E14 147 aa4.21□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 HSBP1O75506 76 aa4.2□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 IGLC6P0CF74 106 aa4.2□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 CTRLP40313 264 aa4.2□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 ASIPP42127 132 aa4.2□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 SPANXN1Q5VSR9 72 aa4.2□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.2□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00587B1AMM8 73 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 USP17L23D6RBM5 183 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 SCGB1D1O95968 90 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 PPBPP02775 128 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 PRSS1P07477 247 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 OR5AL1P0C617 328 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 RAB4AP20338 218 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 PMCHP20382 165 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 CKS2P33552 79 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 AMTP48728 403 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 UBE2D3P61077 147 aa4.19□□□□□ -1.74
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HOXD8-202ENST00000429017 CTAG1AP78358 180 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 ORMDL3Q8N138 153 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 CNFNQ9BYD5 112 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 TNXBP22105 4242 aa4.18□□□□□ -1.74
HOXD8-202ENST00000429017 A0A087WX48 190 aa4.18□□□□□ -1.74
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