RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1B0GUV1	79 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651		F5H697	171 aa		5	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	SIX6	O95475	246 aa		5	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	SMIM6	P0DI80	62 aa		5	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	TAS2R45	P59539	299 aa		5	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		5	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZFP82	Q8N141	532 aa		5	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM243	Q9BU79	118 aa		5	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		5	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	WFDC1	Q9HC57	220 aa		5	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	PAGE4	O60829	102 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	MT1H	P80294	61 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	PEA15	Q15121	130 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651		Q86TA4	180 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	XCL1	P47992	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651		M0QY20	66 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	CRYGA	P11844	174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	S100P	P25815	95 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	GCHFR	P30047	84 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651		G3V3Q6	166 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCL25	O15444	150 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRIAP1	O43715	76 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	H2BFS	P57053	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1W2PPV4	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651		K7EQM0	130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	MGP	P08493	103 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	S100A2	P29034	98 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	CAMP	P49913	170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	RHEB	Q15382	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBE2G2	P60604	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	PEX7	O00628	323 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBE2L6	O14933	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	SNAI2	O43623	268 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	APOM	O95445	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	FGF6	P10767	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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