RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 NPC2P61916 151 aa16.15■□□□□ 0.18
PITX1-201ENST00000265340 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PITX1-201ENST00000265340 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
PITX1-201ENST00000265340 A0A096LNT2 108 aa16.14■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 FAM222AQ5U5X8 452 aa16.14■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 COX7A2LO14548 114 aa16.14■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 AVPP01185 164 aa16.14■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 Q6JHZ5 121 aa16.14■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 TLN2Q9Y4G6 2542 aa16.13■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 TEX15Q9BXT5 2789 aa16.13■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa16.13■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa16.13■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa16.13■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 MED14OSP0DP75 135 aa16.13■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 ZNF415Q09FC8 603 aa16.13■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa16.13■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa16.13■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 C15orf32Q32M92 178 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 PRIMA1Q86XR5 153 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 PKIGQ9Y2B9 76 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 CR1P17927 2039 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 ACANP16112 2415 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa16.11■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 USP17L23D6RBM5 183 aa16.11■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 FHL2Q14192 279 aa16.11■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 ZNF580Q9UK33 172 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 C22orf24Q9Y442 160 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 V9GYY9 64 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 BAALC-AS2P0C853 105 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 BEAN1Q3B7T3 259 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 MOB4Q9Y3A3 225 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 S100A4P26447 101 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 LY6EQ16553 131 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 KLK9Q2XQG4 91 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 KLK9Q9UKQ9 250 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 SERP1Q9Y6X1 66 aa16.08■□□□□ 0.17
PITX1-201ENST00000265340 CCDC140Q96MF4 163 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 B4DSR2 109 aa16.07■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa16.07■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 LINC00315P59091 139 aa16.07■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 PRR9Q5T870 116 aa16.07■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 LINC01561Q8N1V8 128 aa16.07■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 LENEPQ9Y5L5 61 aa16.07■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 A0A0J9YXV3 536 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 H3BUX3 64 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 NDUFA12Q9UI09 145 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 OTOGQ6ZRI0 2925 aa16.06■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 C19orf54Q5BKX5 351 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 C9orf139Q6ZV77 190 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 TIMM17BO60830 172 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 FAM236CP0DP71 79 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 EDN2P20800 178 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 CLEC19AQ6UXS0 136 aa16.05■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa16.04■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 LINC01356Q8N9X3 169 aa16.04■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa16.04■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 NXPH4O95158 308 aa16.03■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 IGHV4-31P0DP07 118 aa16.03■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 A6NDX4 124 aa16.03■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 A0A087WVE0 104 aa16.02■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 TRAV21A0A0B4J279 112 aa16.02■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa16.02■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa16.02■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 SONP18583 2426 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PITX1-201ENST00000265340 BLCAPP62952 87 aa16.02■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 SUMO4Q6EEV6 95 aa16.02■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 TMEM243Q9BU79 118 aa16.02■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 FAM223BA6NKX1 122 aa16.01■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 C16orf95Q9H693 158 aa16.01■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 CLPSL1A2RUU4 121 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 DNAL4O96015 105 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 MXRA5Q9NR99 2828 aa15.98■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa15.98■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa15.98■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 C1orf195Q5TG92 126 aa15.98■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 FAM223AQ8IWN6 122 aa15.98■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 IGHG2P01859 326 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 IGF1P05019 195 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PITX1-201ENST00000265340 SMIM26A0A096LP01 95 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX1-201ENST00000265340 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX1-201ENST00000265340 C20orf203Q8NBC4 194 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX1-201ENST00000265340 TRBV12-3P01733 135 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX1-201ENST00000265340 DEFB112Q30KQ8 113 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX1-201ENST00000265340 VSIG2Q96IQ7 327 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX1-201ENST00000265340 NACAE9PAV3 2078 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.1 ms