RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263012.10

NOMO3-201, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 3,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-201ENST00000263012 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 C10orf105Q8TEF2 133 aa13.12□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 AVPP01185 164 aa13.12□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa13.11□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 TMEM223A0PJW6 202 aa13.11□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 HAMPP81172 84 aa13.11□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 VSIG2Q96IQ7 327 aa13.11□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 CUBNO60494 3623 aa13.11□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 PIFOQ8TCI5 191 aa13.11□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa13.11□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 SLPIP03973 132 aa13.11□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 HERVK_113P63121 156 aa13.11□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 GPHB5Q86YW7 130 aa13.11□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 Q6ZTI0 123 aa13.1□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa13.1□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 SPATA25Q9BR10 227 aa13.1□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 CRYGDP07320 174 aa13.1□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 HERV-K104P63124 156 aa13.1□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa13.1□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 IGIPA6NJ69 53 aa13.1□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 C11orf71Q6IPW1 123 aa13.1□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 POM121L12Q8N7R1 296 aa13.09□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 Q9UF83 564 aa13.09□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 LECT2O14960 151 aa13.09□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 TSHBP01222 138 aa13.09□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 A6NDX4 124 aa13.08□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 C14orf132Q9NPU4 83 aa13.08□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 VPREB3Q9UKI3 123 aa13.08□□□□□ -0.31
NOMO3-201ENST00000263012 NBL1P41271 181 aa13.08□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa13.08□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 CITED1Q99966 193 aa13.08□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 HECTD1Q9ULT8 2610 aa13.08□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ITPR1Q14643 2758 aa13.07□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa13.07□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 UBE2D1P51668 147 aa13.07□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa13.07□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa13.06□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SPANXA1Q9NS26 97 aa13.06□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 K7EQG2 157 aa13.06□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SOCS3O14543 225 aa13.05□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ELANEP08246 267 aa13.05□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 MIAQ16674 131 aa13.05□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ANGP03950 147 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 WFDC10AQ9H1F0 79 aa13.05□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SDIM1Q6ZPB5 146 aa13.04□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 INAFM2P0DMQ5 153 aa13.04□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 H3BUA1 57 aa13.04□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 DCANP1Q8TF63 244 aa13.03□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 MED14OSP0DP75 135 aa13.03□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa13.02□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 CDIP1Q9H305 208 aa13.02□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ATRQ13535 2644 aa13.02□□□□□ -0.32
NOMO3-201ENST00000263012 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa13.02□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 A0A1B0GX51 115 aa13.02□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 K7EMT4 169 aa13.02□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 KLLNB2CW77 178 aa13.01□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa13.01□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 A0A0B4J2C4 111 aa13.01□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa13.01□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 F5H768 121 aa13.01□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 SS18Q15532 418 aa13.01□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 CCL24O00175 119 aa13□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 H7C423 109 aa12.99□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 LINC00308Q8TCZ7 52 aa12.99□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 MAP6D1Q9H9H5 199 aa12.99□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa12.99□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 TMEM126AQ9H061 195 aa12.98□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 FLNCQ14315 2725 aa12.98□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 Q6ZSN1 163 aa12.98□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 UBE2D3P61077 147 aa12.98□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 UBE2D2P62837 147 aa12.98□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 LINC00526Q96FQ7 95 aa12.98□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 H3BT86 120 aa12.97□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 K7EQD1 137 aa12.97□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 GYPEP15421 78 aa12.97□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 COX7B2Q8TF08 81 aa12.96□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 CFAP46Q8IYW2 2715 aa12.96□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
NOMO3-201ENST00000263012 DSCR9P59020 149 aa12.96□□□□□ -0.34
NOMO3-201ENST00000263012 NCR3O14931 201 aa12.95□□□□□ -0.34
NOMO3-201ENST00000263012 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
NOMO3-201ENST00000263012 PRO0461Q9UI25 63 aa12.95□□□□□ -0.34
NOMO3-201ENST00000263012 PLA2G2AP14555 144 aa12.95□□□□□ -0.34
NOMO3-201ENST00000263012 COX8CQ7Z4L0 72 aa12.95□□□□□ -0.34
NOMO3-201ENST00000263012 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
NOMO3-201ENST00000263012 TRAV25A0A0B4J276 109 aa12.94□□□□□ -0.34
NOMO3-201ENST00000263012 COX6A2Q02221 97 aa12.94□□□□□ -0.34
NOMO3-201ENST00000263012 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
NOMO3-201ENST00000263012 LINC00694P0DN24 101 aa12.93□□□□□ -0.34
NOMO3-201ENST00000263012 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa12.93□□□□□ -0.34
NOMO3-201ENST00000263012 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa12.92□□□□□ -0.34
NOMO3-201ENST00000263012 PSMB8P28062 276 aa12.92□□□□□ -0.34
NOMO3-201ENST00000263012 TRACP01848 142 aa12.92□□□□□ -0.34
NOMO3-201ENST00000263012 C9orf85Q96MD7 179 aa12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms